Protein–RNA interactions for Protein: P28078

H2-DMa, Class II histocompatibility antigen, M alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-DMaP28078 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2-DMaP28078 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2-DMaP28078 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2-DMaP28078 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2-DMaP28078 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2-DMaP28078 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2-DMaP28078 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2-DMaP28078 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2-DMaP28078 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2-DMaP28078 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2-DMaP28078 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2-DMaP28078 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2-DMaP28078 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2-DMaP28078 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2-DMaP28078 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2-DMaP28078 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2-DMaP28078 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2-DMaP28078 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2-DMaP28078 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2-DMaP28078 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2-DMaP28078 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2-DMaP28078 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2-DMaP28078 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2-DMaP28078 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2-DMaP28078 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2-DMaP28078 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2-DMaP28078 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2-DMaP28078 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2-DMaP28078 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
H2-DMaP28078 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-DMaP28078 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-DMaP28078 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-DMaP28078 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-DMaP28078 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-DMaP28078 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-DMaP28078 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-DMaP28078 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-DMaP28078 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-DMaP28078 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-DMaP28078 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-DMaP28078 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-DMaP28078 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-DMaP28078 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-DMaP28078 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-DMaP28078 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-DMaP28078 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-DMaP28078 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-DMaP28078 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-DMaP28078 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-DMaP28078 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-DMaP28078 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2-DMaP28078 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2-DMaP28078 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2-DMaP28078 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2-DMaP28078 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2-DMaP28078 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2-DMaP28078 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2-DMaP28078 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2-DMaP28078 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2-DMaP28078 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2-DMaP28078 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
H2-DMaP28078 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2-DMaP28078 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2-DMaP28078 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2-DMaP28078 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2-DMaP28078 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2-DMaP28078 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2-DMaP28078 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2-DMaP28078 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2-DMaP28078 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2-DMaP28078 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2-DMaP28078 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
H2-DMaP28078 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-DMaP28078 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-DMaP28078 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-DMaP28078 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-DMaP28078 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-DMaP28078 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-DMaP28078 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-DMaP28078 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-DMaP28078 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-DMaP28078 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-DMaP28078 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-DMaP28078 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-DMaP28078 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-DMaP28078 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-DMaP28078 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-DMaP28078 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-DMaP28078 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-DMaP28078 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-DMaP28078 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-DMaP28078 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-DMaP28078 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-DMaP28078 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-DMaP28078 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-DMaP28078 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-DMaP28078 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-DMaP28078 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-DMaP28078 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-DMaP28078 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms