Protein–RNA interactions for Protein: P27790

Cenpb, Major centromere autoantigen B, mousemouse

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenpbP27790 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CenpbP27790 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CenpbP27790 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CenpbP27790 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CenpbP27790 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CenpbP27790 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CenpbP27790 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CenpbP27790 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CenpbP27790 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CenpbP27790 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CenpbP27790 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CenpbP27790 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CenpbP27790 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CenpbP27790 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CenpbP27790 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CenpbP27790 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CenpbP27790 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CenpbP27790 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CenpbP27790 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CenpbP27790 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CenpbP27790 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CenpbP27790 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CenpbP27790 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CenpbP27790 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CenpbP27790 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CenpbP27790 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CenpbP27790 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CenpbP27790 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CenpbP27790 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CenpbP27790 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CenpbP27790 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CenpbP27790 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CenpbP27790 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CenpbP27790 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CenpbP27790 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CenpbP27790 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CenpbP27790 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CenpbP27790 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CenpbP27790 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CenpbP27790 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CenpbP27790 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CenpbP27790 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CenpbP27790 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CenpbP27790 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CenpbP27790 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CenpbP27790 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CenpbP27790 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CenpbP27790 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CenpbP27790 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CenpbP27790 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CenpbP27790 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CenpbP27790 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CenpbP27790 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CenpbP27790 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CenpbP27790 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CenpbP27790 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CenpbP27790 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CenpbP27790 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CenpbP27790 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CenpbP27790 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CenpbP27790 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CenpbP27790 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CenpbP27790 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CenpbP27790 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CenpbP27790 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CenpbP27790 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CenpbP27790 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CenpbP27790 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CenpbP27790 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CenpbP27790 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CenpbP27790 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CenpbP27790 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CenpbP27790 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CenpbP27790 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CenpbP27790 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CenpbP27790 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CenpbP27790 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CenpbP27790 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CenpbP27790 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CenpbP27790 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CenpbP27790 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CenpbP27790 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CenpbP27790 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CenpbP27790 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CenpbP27790 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CenpbP27790 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CenpbP27790 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CenpbP27790 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CenpbP27790 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CenpbP27790 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CenpbP27790 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CenpbP27790 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CenpbP27790 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CenpbP27790 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CenpbP27790 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CenpbP27790 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CenpbP27790 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CenpbP27790 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CenpbP27790 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CenpbP27790 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms