Protein–RNA interactions for Protein: P26361

Cftr, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, mousemouse

Predictions only

Length 1,476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CftrP26361 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
CftrP26361 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
CftrP26361 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC32.61■■■□□ 2.81
CftrP26361 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
CftrP26361 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
CftrP26361 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
CftrP26361 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
CftrP26361 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
CftrP26361 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
CftrP26361 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
CftrP26361 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
CftrP26361 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
CftrP26361 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
CftrP26361 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC32.6■■■□□ 2.81
CftrP26361 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC32.6■■■□□ 2.81
CftrP26361 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
CftrP26361 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC32.59■■■□□ 2.81
CftrP26361 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
CftrP26361 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
CftrP26361 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
CftrP26361 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
CftrP26361 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
CftrP26361 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC32.58■■■□□ 2.81
CftrP26361 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
CftrP26361 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC32.58■■■□□ 2.81
CftrP26361 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.81
CftrP26361 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
CftrP26361 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC32.57■■■□□ 2.8
CftrP26361 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.8
CftrP26361 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
CftrP26361 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
CftrP26361 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.8
CftrP26361 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
CftrP26361 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
CftrP26361 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
CftrP26361 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
CftrP26361 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
CftrP26361 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
CftrP26361 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
CftrP26361 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
CftrP26361 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.55■■■□□ 2.8
CftrP26361 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
CftrP26361 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
CftrP26361 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
CftrP26361 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
CftrP26361 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
CftrP26361 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
CftrP26361 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
CftrP26361 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
CftrP26361 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
CftrP26361 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
CftrP26361 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
CftrP26361 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
CftrP26361 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
CftrP26361 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
CftrP26361 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
CftrP26361 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
CftrP26361 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
CftrP26361 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
CftrP26361 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
CftrP26361 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
CftrP26361 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
CftrP26361 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC32.53■■■□□ 2.8
CftrP26361 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
CftrP26361 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
CftrP26361 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
CftrP26361 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.52■■■□□ 2.8
CftrP26361 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
CftrP26361 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.8
CftrP26361 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
CftrP26361 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC32.5■■■□□ 2.79
CftrP26361 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
CftrP26361 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
CftrP26361 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
CftrP26361 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
CftrP26361 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
CftrP26361 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
CftrP26361 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
CftrP26361 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
CftrP26361 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
CftrP26361 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
CftrP26361 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC32.48■■■□□ 2.79
CftrP26361 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
CftrP26361 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
CftrP26361 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
CftrP26361 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
CftrP26361 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
CftrP26361 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC32.47■■■□□ 2.79
CftrP26361 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC32.47■■■□□ 2.79
CftrP26361 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC32.47■■■□□ 2.79
CftrP26361 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
CftrP26361 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
CftrP26361 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
CftrP26361 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
CftrP26361 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
CftrP26361 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
CftrP26361 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
CftrP26361 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
CftrP26361 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
CftrP26361 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms