Protein–RNA interactions for Protein: P24788

Cdk11b, Cyclin-dependent kinase 11B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk11bP24788 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Cdk11bP24788 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Cdk11bP24788 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Cdk11bP24788 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Cdk11bP24788 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Cdk11bP24788 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Cdk11bP24788 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Cdk11bP24788 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Cdk11bP24788 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Cdk11bP24788 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Cdk11bP24788 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Cdk11bP24788 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Cdk11bP24788 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
Cdk11bP24788 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
Cdk11bP24788 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Cdk11bP24788 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Cdk11bP24788 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Cdk11bP24788 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Cdk11bP24788 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Cdk11bP24788 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Cdk11bP24788 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Cdk11bP24788 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Cdk11bP24788 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Cdk11bP24788 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Cdk11bP24788 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Cdk11bP24788 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
Cdk11bP24788 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Cdk11bP24788 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Cdk11bP24788 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Cdk11bP24788 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Cdk11bP24788 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Cdk11bP24788 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
Cdk11bP24788 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Cdk11bP24788 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Cdk11bP24788 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Cdk11bP24788 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Cdk11bP24788 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Cdk11bP24788 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Cdk11bP24788 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Cdk11bP24788 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Cdk11bP24788 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Cdk11bP24788 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Cdk11bP24788 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Cdk11bP24788 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
Cdk11bP24788 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Cdk11bP24788 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Cdk11bP24788 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Cdk11bP24788 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
Cdk11bP24788 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Cdk11bP24788 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Cdk11bP24788 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Cdk11bP24788 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Cdk11bP24788 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Cdk11bP24788 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Cdk11bP24788 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Cdk11bP24788 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Cdk11bP24788 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Cdk11bP24788 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Cdk11bP24788 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Cdk11bP24788 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Cdk11bP24788 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Cdk11bP24788 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Cdk11bP24788 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Cdk11bP24788 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Cdk11bP24788 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Cdk11bP24788 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Cdk11bP24788 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Cdk11bP24788 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Cdk11bP24788 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Cdk11bP24788 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Cdk11bP24788 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Cdk11bP24788 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
Cdk11bP24788 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Cdk11bP24788 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Cdk11bP24788 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Cdk11bP24788 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Cdk11bP24788 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Cdk11bP24788 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Cdk11bP24788 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Cdk11bP24788 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Cdk11bP24788 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
Cdk11bP24788 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Cdk11bP24788 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Cdk11bP24788 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Cdk11bP24788 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Cdk11bP24788 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Cdk11bP24788 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
Cdk11bP24788 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Cdk11bP24788 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Cdk11bP24788 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Cdk11bP24788 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Cdk11bP24788 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Cdk11bP24788 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
Cdk11bP24788 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Cdk11bP24788 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Cdk11bP24788 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Cdk11bP24788 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Cdk11bP24788 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Cdk11bP24788 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Cdk11bP24788 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms