Protein–RNA interactions for Protein: P23818

Gria1, Glutamate receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gria1P23818 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gria1P23818 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gria1P23818 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gria1P23818 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gria1P23818 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gria1P23818 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gria1P23818 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gria1P23818 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gria1P23818 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gria1P23818 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gria1P23818 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gria1P23818 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gria1P23818 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gria1P23818 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Gria1P23818 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gria1P23818 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gria1P23818 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gria1P23818 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gria1P23818 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gria1P23818 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gria1P23818 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gria1P23818 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gria1P23818 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Gria1P23818 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gria1P23818 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gria1P23818 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gria1P23818 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gria1P23818 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gria1P23818 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gria1P23818 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gria1P23818 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gria1P23818 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gria1P23818 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gria1P23818 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gria1P23818 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gria1P23818 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gria1P23818 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gria1P23818 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gria1P23818 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gria1P23818 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gria1P23818 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gria1P23818 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gria1P23818 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gria1P23818 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gria1P23818 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gria1P23818 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gria1P23818 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Gria1P23818 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gria1P23818 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gria1P23818 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gria1P23818 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gria1P23818 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gria1P23818 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Gria1P23818 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gria1P23818 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gria1P23818 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gria1P23818 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gria1P23818 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gria1P23818 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gria1P23818 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gria1P23818 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gria1P23818 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gria1P23818 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gria1P23818 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gria1P23818 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gria1P23818 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gria1P23818 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gria1P23818 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gria1P23818 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gria1P23818 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gria1P23818 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gria1P23818 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gria1P23818 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gria1P23818 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gria1P23818 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gria1P23818 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gria1P23818 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Gria1P23818 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gria1P23818 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Gria1P23818 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gria1P23818 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gria1P23818 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Gria1P23818 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Gria1P23818 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gria1P23818 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gria1P23818 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gria1P23818 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gria1P23818 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gria1P23818 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gria1P23818 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gria1P23818 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gria1P23818 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gria1P23818 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gria1P23818 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gria1P23818 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gria1P23818 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gria1P23818 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gria1P23818 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gria1P23818 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gria1P23818 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.1 ms