Protein–RNA interactions for Protein: P20664

Prim1, DNA primase small subunit, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prim1P20664 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Prim1P20664 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Prim1P20664 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Prim1P20664 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Prim1P20664 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Prim1P20664 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Prim1P20664 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Prim1P20664 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Prim1P20664 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Prim1P20664 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Prim1P20664 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Prim1P20664 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Prim1P20664 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Prim1P20664 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Prim1P20664 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Prim1P20664 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Prim1P20664 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Prim1P20664 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Prim1P20664 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Prim1P20664 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Prim1P20664 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Prim1P20664 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Prim1P20664 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Prim1P20664 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Prim1P20664 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Prim1P20664 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Prim1P20664 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Prim1P20664 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Prim1P20664 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Prim1P20664 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Prim1P20664 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Prim1P20664 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Prim1P20664 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Prim1P20664 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Prim1P20664 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Prim1P20664 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Prim1P20664 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Prim1P20664 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Prim1P20664 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Prim1P20664 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Prim1P20664 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Prim1P20664 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Prim1P20664 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Prim1P20664 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Prim1P20664 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Prim1P20664 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Prim1P20664 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Prim1P20664 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Prim1P20664 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Prim1P20664 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Prim1P20664 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Prim1P20664 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Prim1P20664 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Prim1P20664 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Prim1P20664 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Prim1P20664 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Prim1P20664 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Prim1P20664 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Prim1P20664 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Prim1P20664 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Prim1P20664 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Prim1P20664 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Prim1P20664 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Prim1P20664 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Prim1P20664 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Prim1P20664 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Prim1P20664 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Prim1P20664 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Prim1P20664 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Prim1P20664 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Prim1P20664 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Prim1P20664 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Prim1P20664 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Prim1P20664 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Prim1P20664 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Prim1P20664 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Prim1P20664 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Prim1P20664 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Prim1P20664 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Prim1P20664 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Prim1P20664 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Prim1P20664 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Prim1P20664 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Prim1P20664 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Prim1P20664 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Prim1P20664 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Prim1P20664 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Prim1P20664 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Prim1P20664 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Prim1P20664 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Prim1P20664 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Prim1P20664 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Prim1P20664 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Prim1P20664 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Prim1P20664 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Prim1P20664 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Prim1P20664 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Prim1P20664 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Prim1P20664 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Prim1P20664 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms