Protein–RNA interactions for Protein: P20615

Hoxb9, Homeobox protein Hox-B9, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb9P20615 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxb9P20615 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxb9P20615 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxb9P20615 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxb9P20615 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxb9P20615 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxb9P20615 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxb9P20615 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxb9P20615 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxb9P20615 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxb9P20615 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxb9P20615 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxb9P20615 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxb9P20615 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxb9P20615 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxb9P20615 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxb9P20615 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxb9P20615 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxb9P20615 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxb9P20615 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxb9P20615 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxb9P20615 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxb9P20615 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxb9P20615 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxb9P20615 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxb9P20615 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxb9P20615 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxb9P20615 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxb9P20615 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxb9P20615 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxb9P20615 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxb9P20615 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxb9P20615 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hoxb9P20615 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hoxb9P20615 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Hoxb9P20615 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hoxb9P20615 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hoxb9P20615 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hoxb9P20615 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hoxb9P20615 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hoxb9P20615 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hoxb9P20615 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hoxb9P20615 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hoxb9P20615 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hoxb9P20615 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hoxb9P20615 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hoxb9P20615 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hoxb9P20615 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hoxb9P20615 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hoxb9P20615 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hoxb9P20615 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hoxb9P20615 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hoxb9P20615 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hoxb9P20615 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hoxb9P20615 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hoxb9P20615 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hoxb9P20615 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hoxb9P20615 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hoxb9P20615 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Hoxb9P20615 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hoxb9P20615 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hoxb9P20615 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hoxb9P20615 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hoxb9P20615 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hoxb9P20615 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hoxb9P20615 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hoxb9P20615 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hoxb9P20615 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hoxb9P20615 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hoxb9P20615 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hoxb9P20615 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hoxb9P20615 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxb9P20615 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxb9P20615 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxb9P20615 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxb9P20615 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxb9P20615 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxb9P20615 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxb9P20615 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxb9P20615 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxb9P20615 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxb9P20615 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxb9P20615 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxb9P20615 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxb9P20615 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxb9P20615 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxb9P20615 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxb9P20615 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxb9P20615 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxb9P20615 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxb9P20615 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxb9P20615 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxb9P20615 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxb9P20615 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxb9P20615 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxb9P20615 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxb9P20615 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxb9P20615 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxb9P20615 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxb9P20615 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms