Protein–RNA interactions for Protein: P18653

Rps6ka1, Ribosomal protein S6 kinase alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka1P18653 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rps6ka1P18653 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rps6ka1P18653 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rps6ka1P18653 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rps6ka1P18653 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rps6ka1P18653 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rps6ka1P18653 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rps6ka1P18653 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rps6ka1P18653 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rps6ka1P18653 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rps6ka1P18653 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rps6ka1P18653 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rps6ka1P18653 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rps6ka1P18653 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rps6ka1P18653 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rps6ka1P18653 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rps6ka1P18653 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rps6ka1P18653 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rps6ka1P18653 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rps6ka1P18653 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rps6ka1P18653 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rps6ka1P18653 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rps6ka1P18653 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rps6ka1P18653 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Rps6ka1P18653 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rps6ka1P18653 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rps6ka1P18653 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rps6ka1P18653 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rps6ka1P18653 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rps6ka1P18653 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rps6ka1P18653 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rps6ka1P18653 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Rps6ka1P18653 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Rps6ka1P18653 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rps6ka1P18653 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rps6ka1P18653 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rps6ka1P18653 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rps6ka1P18653 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rps6ka1P18653 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rps6ka1P18653 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rps6ka1P18653 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rps6ka1P18653 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rps6ka1P18653 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rps6ka1P18653 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rps6ka1P18653 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rps6ka1P18653 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rps6ka1P18653 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rps6ka1P18653 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rps6ka1P18653 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rps6ka1P18653 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rps6ka1P18653 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rps6ka1P18653 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rps6ka1P18653 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rps6ka1P18653 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rps6ka1P18653 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rps6ka1P18653 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Rps6ka1P18653 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rps6ka1P18653 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rps6ka1P18653 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rps6ka1P18653 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rps6ka1P18653 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rps6ka1P18653 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rps6ka1P18653 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rps6ka1P18653 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rps6ka1P18653 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rps6ka1P18653 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Rps6ka1P18653 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rps6ka1P18653 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rps6ka1P18653 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rps6ka1P18653 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rps6ka1P18653 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rps6ka1P18653 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Rps6ka1P18653 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rps6ka1P18653 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rps6ka1P18653 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rps6ka1P18653 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rps6ka1P18653 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rps6ka1P18653 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rps6ka1P18653 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rps6ka1P18653 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rps6ka1P18653 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rps6ka1P18653 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rps6ka1P18653 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rps6ka1P18653 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rps6ka1P18653 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rps6ka1P18653 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rps6ka1P18653 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rps6ka1P18653 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rps6ka1P18653 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rps6ka1P18653 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rps6ka1P18653 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rps6ka1P18653 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rps6ka1P18653 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rps6ka1P18653 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rps6ka1P18653 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rps6ka1P18653 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rps6ka1P18653 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rps6ka1P18653 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rps6ka1P18653 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rps6ka1P18653 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms