Protein–RNA interactions for Protein: P18532

Ig heavy chain V region 1B43, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18532 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
P18532 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
P18532 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
P18532 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
P18532 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
P18532 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
P18532 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
P18532 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
P18532 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
P18532 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
P18532 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P18532 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
P18532 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P18532 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
P18532 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P18532 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
P18532 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P18532 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P18532 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
P18532 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
P18532 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P18532 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P18532 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P18532 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P18532 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
P18532 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
P18532 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P18532 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
P18532 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P18532 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
P18532 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
P18532 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
P18532 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P18532 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P18532 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P18532 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P18532 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
P18532 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
P18532 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P18532 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P18532 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
P18532 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P18532 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P18532 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
P18532 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
P18532 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P18532 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
P18532 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P18532 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P18532 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
P18532 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P18532 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P18532 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P18532 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
P18532 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P18532 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
P18532 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P18532 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P18532 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P18532 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P18532 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P18532 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
P18532 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
P18532 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P18532 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
P18532 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
P18532 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P18532 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P18532 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
P18532 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P18532 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
P18532 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P18532 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
P18532 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
P18532 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
P18532 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
P18532 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
P18532 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P18532 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
P18532 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
P18532 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
P18532 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P18532 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
P18532 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
P18532 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P18532 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P18532 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P18532 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
P18532 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P18532 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
P18532 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P18532 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
P18532 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P18532 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P18532 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P18532 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P18532 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P18532 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P18532 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
P18532 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms