Protein–RNA interactions for Protein: P17125

Tgfb3, Transforming growth factor beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfb3P17125 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tgfb3P17125 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tgfb3P17125 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tgfb3P17125 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tgfb3P17125 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Tgfb3P17125 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tgfb3P17125 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tgfb3P17125 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tgfb3P17125 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tgfb3P17125 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tgfb3P17125 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tgfb3P17125 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tgfb3P17125 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tgfb3P17125 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tgfb3P17125 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tgfb3P17125 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tgfb3P17125 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tgfb3P17125 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tgfb3P17125 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tgfb3P17125 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tgfb3P17125 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tgfb3P17125 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tgfb3P17125 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tgfb3P17125 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tgfb3P17125 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tgfb3P17125 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tgfb3P17125 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tgfb3P17125 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tgfb3P17125 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tgfb3P17125 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tgfb3P17125 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tgfb3P17125 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tgfb3P17125 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tgfb3P17125 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tgfb3P17125 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tgfb3P17125 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tgfb3P17125 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Tgfb3P17125 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Tgfb3P17125 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tgfb3P17125 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tgfb3P17125 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tgfb3P17125 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tgfb3P17125 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tgfb3P17125 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tgfb3P17125 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tgfb3P17125 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tgfb3P17125 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tgfb3P17125 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Tgfb3P17125 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tgfb3P17125 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tgfb3P17125 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tgfb3P17125 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tgfb3P17125 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Tgfb3P17125 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tgfb3P17125 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tgfb3P17125 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Tgfb3P17125 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tgfb3P17125 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tgfb3P17125 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tgfb3P17125 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tgfb3P17125 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tgfb3P17125 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tgfb3P17125 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tgfb3P17125 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tgfb3P17125 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tgfb3P17125 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tgfb3P17125 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tgfb3P17125 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tgfb3P17125 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tgfb3P17125 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tgfb3P17125 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tgfb3P17125 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tgfb3P17125 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tgfb3P17125 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tgfb3P17125 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tgfb3P17125 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tgfb3P17125 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tgfb3P17125 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tgfb3P17125 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tgfb3P17125 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tgfb3P17125 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tgfb3P17125 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tgfb3P17125 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Tgfb3P17125 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Tgfb3P17125 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tgfb3P17125 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Tgfb3P17125 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tgfb3P17125 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tgfb3P17125 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tgfb3P17125 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tgfb3P17125 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tgfb3P17125 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tgfb3P17125 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tgfb3P17125 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tgfb3P17125 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tgfb3P17125 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tgfb3P17125 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tgfb3P17125 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tgfb3P17125 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tgfb3P17125 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms