Protein–RNA interactions for Protein: P14869

Rplp0, 60S acidic ribosomal protein P0, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rplp0P14869 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rplp0P14869 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rplp0P14869 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rplp0P14869 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rplp0P14869 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rplp0P14869 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rplp0P14869 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rplp0P14869 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rplp0P14869 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rplp0P14869 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rplp0P14869 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rplp0P14869 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rplp0P14869 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rplp0P14869 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rplp0P14869 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rplp0P14869 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rplp0P14869 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rplp0P14869 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rplp0P14869 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rplp0P14869 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Rplp0P14869 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rplp0P14869 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rplp0P14869 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rplp0P14869 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rplp0P14869 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rplp0P14869 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rplp0P14869 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rplp0P14869 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rplp0P14869 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Rplp0P14869 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rplp0P14869 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Rplp0P14869 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rplp0P14869 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rplp0P14869 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rplp0P14869 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rplp0P14869 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rplp0P14869 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rplp0P14869 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rplp0P14869 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rplp0P14869 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rplp0P14869 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rplp0P14869 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rplp0P14869 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rplp0P14869 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rplp0P14869 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rplp0P14869 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rplp0P14869 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rplp0P14869 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rplp0P14869 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rplp0P14869 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rplp0P14869 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Rplp0P14869 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rplp0P14869 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rplp0P14869 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rplp0P14869 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rplp0P14869 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rplp0P14869 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rplp0P14869 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rplp0P14869 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rplp0P14869 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rplp0P14869 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rplp0P14869 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rplp0P14869 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rplp0P14869 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rplp0P14869 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rplp0P14869 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rplp0P14869 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rplp0P14869 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rplp0P14869 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rplp0P14869 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rplp0P14869 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rplp0P14869 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rplp0P14869 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Rplp0P14869 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rplp0P14869 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rplp0P14869 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rplp0P14869 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rplp0P14869 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rplp0P14869 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Rplp0P14869 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rplp0P14869 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rplp0P14869 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rplp0P14869 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rplp0P14869 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rplp0P14869 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rplp0P14869 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rplp0P14869 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rplp0P14869 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rplp0P14869 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rplp0P14869 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rplp0P14869 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rplp0P14869 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Rplp0P14869 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rplp0P14869 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rplp0P14869 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rplp0P14869 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rplp0P14869 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rplp0P14869 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rplp0P14869 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rplp0P14869 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms