Protein–RNA interactions for Protein: P13412

Tnni2, Troponin I, fast skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnni2P13412 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tnni2P13412 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tnni2P13412 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tnni2P13412 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tnni2P13412 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tnni2P13412 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tnni2P13412 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tnni2P13412 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tnni2P13412 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tnni2P13412 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tnni2P13412 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tnni2P13412 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tnni2P13412 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Tnni2P13412 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tnni2P13412 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tnni2P13412 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tnni2P13412 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tnni2P13412 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tnni2P13412 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tnni2P13412 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tnni2P13412 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tnni2P13412 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tnni2P13412 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tnni2P13412 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tnni2P13412 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tnni2P13412 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tnni2P13412 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tnni2P13412 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tnni2P13412 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tnni2P13412 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tnni2P13412 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tnni2P13412 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Tnni2P13412 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tnni2P13412 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tnni2P13412 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tnni2P13412 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tnni2P13412 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tnni2P13412 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tnni2P13412 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Tnni2P13412 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tnni2P13412 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tnni2P13412 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tnni2P13412 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tnni2P13412 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tnni2P13412 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tnni2P13412 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tnni2P13412 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tnni2P13412 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Tnni2P13412 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tnni2P13412 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tnni2P13412 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tnni2P13412 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tnni2P13412 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tnni2P13412 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tnni2P13412 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tnni2P13412 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tnni2P13412 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tnni2P13412 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tnni2P13412 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tnni2P13412 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tnni2P13412 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Tnni2P13412 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tnni2P13412 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tnni2P13412 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tnni2P13412 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tnni2P13412 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tnni2P13412 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tnni2P13412 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tnni2P13412 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Tnni2P13412 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tnni2P13412 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tnni2P13412 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tnni2P13412 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tnni2P13412 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tnni2P13412 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tnni2P13412 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tnni2P13412 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tnni2P13412 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tnni2P13412 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tnni2P13412 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tnni2P13412 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tnni2P13412 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tnni2P13412 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tnni2P13412 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tnni2P13412 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Tnni2P13412 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Tnni2P13412 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tnni2P13412 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tnni2P13412 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tnni2P13412 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tnni2P13412 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tnni2P13412 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tnni2P13412 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tnni2P13412 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tnni2P13412 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tnni2P13412 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tnni2P13412 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tnni2P13412 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tnni2P13412 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tnni2P13412 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms