Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Vpreb2P13373 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Vpreb2P13373 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Vpreb2P13373 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Vpreb2P13373 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Vpreb2P13373 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Vpreb2P13373 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Vpreb2P13373 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Vpreb2P13373 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Vpreb2P13373 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Vpreb2P13373 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Vpreb2P13373 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Vpreb2P13373 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Vpreb2P13373 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Vpreb2P13373 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Vpreb2P13373 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Vpreb2P13373 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Vpreb2P13373 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Vpreb2P13373 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Vpreb2P13373 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Vpreb2P13373 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Vpreb2P13373 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Vpreb2P13373 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Vpreb2P13373 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Vpreb2P13373 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Vpreb2P13373 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Vpreb2P13373 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Vpreb2P13373 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Vpreb2P13373 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Vpreb2P13373 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Vpreb2P13373 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Vpreb2P13373 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Vpreb2P13373 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Vpreb2P13373 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Vpreb2P13373 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Vpreb2P13373 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Vpreb2P13373 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Vpreb2P13373 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Vpreb2P13373 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Vpreb2P13373 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Vpreb2P13373 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Vpreb2P13373 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Vpreb2P13373 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Vpreb2P13373 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Vpreb2P13373 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Vpreb2P13373 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Vpreb2P13373 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Vpreb2P13373 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Vpreb2P13373 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Vpreb2P13373 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Vpreb2P13373 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Vpreb2P13373 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Vpreb2P13373 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Vpreb2P13373 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Vpreb2P13373 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Vpreb2P13373 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Vpreb2P13373 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Vpreb2P13373 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Vpreb2P13373 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Vpreb2P13373 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Vpreb2P13373 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Vpreb2P13373 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Vpreb2P13373 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Vpreb2P13373 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Vpreb2P13373 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Vpreb2P13373 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Vpreb2P13373 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Vpreb2P13373 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Vpreb2P13373 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Vpreb2P13373 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Vpreb2P13373 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Vpreb2P13373 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Vpreb2P13373 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Vpreb2P13373 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Vpreb2P13373 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Vpreb2P13373 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Vpreb2P13373 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Vpreb2P13373 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Vpreb2P13373 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Vpreb2P13373 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Vpreb2P13373 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Vpreb2P13373 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Vpreb2P13373 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Vpreb2P13373 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Vpreb2P13373 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Vpreb2P13373 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Vpreb2P13373 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Vpreb2P13373 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Vpreb2P13373 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Vpreb2P13373 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Vpreb2P13373 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Vpreb2P13373 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Vpreb2P13373 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Vpreb2P13373 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Vpreb2P13373 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Vpreb2P13373 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Vpreb2P13373 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Vpreb2P13373 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Vpreb2P13373 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Vpreb2P13373 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms