Protein–RNA interactions for Protein: P12960

Cntn1, Contactin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,020 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn1P12960 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cntn1P12960 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cntn1P12960 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cntn1P12960 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cntn1P12960 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cntn1P12960 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cntn1P12960 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cntn1P12960 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cntn1P12960 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Cntn1P12960 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Cntn1P12960 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cntn1P12960 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cntn1P12960 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cntn1P12960 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cntn1P12960 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cntn1P12960 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cntn1P12960 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cntn1P12960 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cntn1P12960 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cntn1P12960 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cntn1P12960 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cntn1P12960 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cntn1P12960 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cntn1P12960 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cntn1P12960 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Cntn1P12960 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cntn1P12960 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cntn1P12960 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cntn1P12960 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cntn1P12960 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cntn1P12960 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cntn1P12960 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cntn1P12960 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cntn1P12960 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cntn1P12960 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cntn1P12960 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cntn1P12960 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cntn1P12960 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cntn1P12960 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cntn1P12960 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cntn1P12960 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cntn1P12960 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cntn1P12960 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cntn1P12960 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cntn1P12960 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cntn1P12960 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cntn1P12960 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cntn1P12960 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cntn1P12960 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cntn1P12960 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cntn1P12960 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cntn1P12960 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cntn1P12960 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cntn1P12960 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cntn1P12960 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cntn1P12960 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cntn1P12960 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cntn1P12960 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cntn1P12960 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cntn1P12960 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cntn1P12960 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cntn1P12960 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cntn1P12960 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cntn1P12960 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cntn1P12960 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cntn1P12960 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cntn1P12960 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cntn1P12960 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cntn1P12960 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cntn1P12960 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cntn1P12960 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cntn1P12960 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cntn1P12960 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cntn1P12960 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cntn1P12960 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cntn1P12960 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cntn1P12960 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cntn1P12960 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cntn1P12960 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cntn1P12960 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cntn1P12960 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cntn1P12960 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cntn1P12960 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cntn1P12960 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cntn1P12960 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cntn1P12960 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cntn1P12960 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cntn1P12960 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cntn1P12960 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cntn1P12960 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Cntn1P12960 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cntn1P12960 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cntn1P12960 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Cntn1P12960 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cntn1P12960 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cntn1P12960 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cntn1P12960 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cntn1P12960 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cntn1P12960 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cntn1P12960 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms