Protein–RNA interactions for Protein: P11403

Fgf4, Fibroblast growth factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgf4P11403 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fgf4P11403 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fgf4P11403 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fgf4P11403 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fgf4P11403 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fgf4P11403 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fgf4P11403 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fgf4P11403 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fgf4P11403 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fgf4P11403 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fgf4P11403 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fgf4P11403 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fgf4P11403 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fgf4P11403 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fgf4P11403 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fgf4P11403 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fgf4P11403 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fgf4P11403 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fgf4P11403 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fgf4P11403 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fgf4P11403 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fgf4P11403 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fgf4P11403 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fgf4P11403 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fgf4P11403 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fgf4P11403 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fgf4P11403 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fgf4P11403 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fgf4P11403 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fgf4P11403 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fgf4P11403 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fgf4P11403 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fgf4P11403 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fgf4P11403 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fgf4P11403 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fgf4P11403 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fgf4P11403 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fgf4P11403 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Fgf4P11403 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Fgf4P11403 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Fgf4P11403 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Fgf4P11403 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fgf4P11403 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fgf4P11403 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fgf4P11403 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fgf4P11403 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fgf4P11403 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Fgf4P11403 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fgf4P11403 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fgf4P11403 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fgf4P11403 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fgf4P11403 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fgf4P11403 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fgf4P11403 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fgf4P11403 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fgf4P11403 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fgf4P11403 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fgf4P11403 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fgf4P11403 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fgf4P11403 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fgf4P11403 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fgf4P11403 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fgf4P11403 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fgf4P11403 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fgf4P11403 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fgf4P11403 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fgf4P11403 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fgf4P11403 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fgf4P11403 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fgf4P11403 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fgf4P11403 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fgf4P11403 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fgf4P11403 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fgf4P11403 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fgf4P11403 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fgf4P11403 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fgf4P11403 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fgf4P11403 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fgf4P11403 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fgf4P11403 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fgf4P11403 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fgf4P11403 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fgf4P11403 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fgf4P11403 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fgf4P11403 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fgf4P11403 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fgf4P11403 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fgf4P11403 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fgf4P11403 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fgf4P11403 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fgf4P11403 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fgf4P11403 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fgf4P11403 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fgf4P11403 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fgf4P11403 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fgf4P11403 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fgf4P11403 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fgf4P11403 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fgf4P11403 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Fgf4P11403 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms