Protein–RNA interactions for Protein: P11378

Tnp2, Nuclear transition protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnp2P11378 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Tnp2P11378 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Tnp2P11378 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Tnp2P11378 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Tnp2P11378 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Tnp2P11378 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Tnp2P11378 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Tnp2P11378 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Tnp2P11378 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tnp2P11378 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tnp2P11378 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tnp2P11378 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tnp2P11378 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tnp2P11378 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tnp2P11378 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tnp2P11378 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Tnp2P11378 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Tnp2P11378 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tnp2P11378 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tnp2P11378 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Tnp2P11378 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Tnp2P11378 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Tnp2P11378 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Tnp2P11378 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Tnp2P11378 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tnp2P11378 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tnp2P11378 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tnp2P11378 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Tnp2P11378 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tnp2P11378 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tnp2P11378 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Tnp2P11378 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tnp2P11378 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Tnp2P11378 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tnp2P11378 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tnp2P11378 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tnp2P11378 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tnp2P11378 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tnp2P11378 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tnp2P11378 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tnp2P11378 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tnp2P11378 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tnp2P11378 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tnp2P11378 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tnp2P11378 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tnp2P11378 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tnp2P11378 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tnp2P11378 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tnp2P11378 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tnp2P11378 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tnp2P11378 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tnp2P11378 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tnp2P11378 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Tnp2P11378 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tnp2P11378 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tnp2P11378 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tnp2P11378 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tnp2P11378 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tnp2P11378 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tnp2P11378 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tnp2P11378 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tnp2P11378 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Tnp2P11378 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tnp2P11378 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tnp2P11378 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tnp2P11378 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tnp2P11378 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tnp2P11378 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tnp2P11378 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tnp2P11378 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tnp2P11378 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tnp2P11378 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tnp2P11378 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tnp2P11378 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tnp2P11378 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tnp2P11378 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tnp2P11378 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tnp2P11378 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Tnp2P11378 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tnp2P11378 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tnp2P11378 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Tnp2P11378 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tnp2P11378 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tnp2P11378 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tnp2P11378 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tnp2P11378 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tnp2P11378 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tnp2P11378 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tnp2P11378 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tnp2P11378 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tnp2P11378 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tnp2P11378 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tnp2P11378 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tnp2P11378 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tnp2P11378 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tnp2P11378 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tnp2P11378 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tnp2P11378 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tnp2P11378 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tnp2P11378 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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