Protein–RNA interactions for Protein: P11088

Flg, Filaggrin (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FlgP11088 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FlgP11088 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FlgP11088 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FlgP11088 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
FlgP11088 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FlgP11088 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FlgP11088 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FlgP11088 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FlgP11088 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FlgP11088 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FlgP11088 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FlgP11088 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FlgP11088 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FlgP11088 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FlgP11088 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FlgP11088 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
FlgP11088 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FlgP11088 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FlgP11088 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FlgP11088 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FlgP11088 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FlgP11088 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FlgP11088 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FlgP11088 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FlgP11088 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FlgP11088 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FlgP11088 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FlgP11088 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FlgP11088 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FlgP11088 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FlgP11088 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
FlgP11088 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FlgP11088 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FlgP11088 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FlgP11088 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FlgP11088 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
FlgP11088 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FlgP11088 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FlgP11088 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.33■■□□□ 1
FlgP11088 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
FlgP11088 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
FlgP11088 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC21.33■■□□□ 1
FlgP11088 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
FlgP11088 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FlgP11088 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FlgP11088 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FlgP11088 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FlgP11088 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC21.32■■□□□ 1
FlgP11088 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FlgP11088 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FlgP11088 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
FlgP11088 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FlgP11088 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FlgP11088 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FlgP11088 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
FlgP11088 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
FlgP11088 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
FlgP11088 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
FlgP11088 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
FlgP11088 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FlgP11088 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FlgP11088 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FlgP11088 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FlgP11088 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FlgP11088 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FlgP11088 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FlgP11088 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FlgP11088 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
FlgP11088 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
FlgP11088 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FlgP11088 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FlgP11088 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.29■■□□□ 1
FlgP11088 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FlgP11088 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
FlgP11088 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FlgP11088 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FlgP11088 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
FlgP11088 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
FlgP11088 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
FlgP11088 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
FlgP11088 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
FlgP11088 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FlgP11088 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FlgP11088 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
FlgP11088 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
FlgP11088 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FlgP11088 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FlgP11088 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FlgP11088 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
FlgP11088 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC21.28■■□□□ 1
FlgP11088 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
FlgP11088 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FlgP11088 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FlgP11088 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FlgP11088 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FlgP11088 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FlgP11088 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
FlgP11088 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FlgP11088 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FlgP11088 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms