Protein–RNA interactions for Protein: P10605

Ctsb, Cathepsin B, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsbP10605 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CtsbP10605 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CtsbP10605 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CtsbP10605 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CtsbP10605 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CtsbP10605 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CtsbP10605 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CtsbP10605 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CtsbP10605 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CtsbP10605 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CtsbP10605 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CtsbP10605 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CtsbP10605 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CtsbP10605 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CtsbP10605 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CtsbP10605 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CtsbP10605 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CtsbP10605 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CtsbP10605 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CtsbP10605 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CtsbP10605 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CtsbP10605 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CtsbP10605 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CtsbP10605 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CtsbP10605 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CtsbP10605 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CtsbP10605 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CtsbP10605 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CtsbP10605 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CtsbP10605 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CtsbP10605 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CtsbP10605 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CtsbP10605 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CtsbP10605 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CtsbP10605 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CtsbP10605 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CtsbP10605 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CtsbP10605 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CtsbP10605 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CtsbP10605 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CtsbP10605 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CtsbP10605 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CtsbP10605 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CtsbP10605 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CtsbP10605 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CtsbP10605 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CtsbP10605 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CtsbP10605 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CtsbP10605 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CtsbP10605 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CtsbP10605 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CtsbP10605 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CtsbP10605 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CtsbP10605 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CtsbP10605 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CtsbP10605 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CtsbP10605 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CtsbP10605 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CtsbP10605 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CtsbP10605 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CtsbP10605 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CtsbP10605 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CtsbP10605 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CtsbP10605 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CtsbP10605 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CtsbP10605 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CtsbP10605 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CtsbP10605 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CtsbP10605 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CtsbP10605 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CtsbP10605 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CtsbP10605 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CtsbP10605 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CtsbP10605 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CtsbP10605 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CtsbP10605 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CtsbP10605 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CtsbP10605 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CtsbP10605 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CtsbP10605 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CtsbP10605 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CtsbP10605 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CtsbP10605 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CtsbP10605 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CtsbP10605 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CtsbP10605 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CtsbP10605 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CtsbP10605 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CtsbP10605 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CtsbP10605 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CtsbP10605 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CtsbP10605 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CtsbP10605 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CtsbP10605 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CtsbP10605 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CtsbP10605 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CtsbP10605 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CtsbP10605 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CtsbP10605 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CtsbP10605 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms