Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

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Length 641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P10404 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P10404 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P10404 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P10404 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P10404 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P10404 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P10404 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P10404 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P10404 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P10404 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P10404 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P10404 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P10404 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P10404 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P10404 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P10404 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P10404 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P10404 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P10404 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P10404 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P10404 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P10404 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P10404 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
P10404 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P10404 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
P10404 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P10404 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P10404 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P10404 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P10404 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P10404 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P10404 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P10404 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
P10404 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
P10404 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
P10404 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
P10404 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
P10404 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P10404 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
P10404 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
P10404 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P10404 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P10404 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P10404 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P10404 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P10404 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P10404 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P10404 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P10404 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P10404 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P10404 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P10404 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
P10404 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P10404 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P10404 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P10404 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P10404 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P10404 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P10404 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P10404 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P10404 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P10404 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P10404 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P10404 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
P10404 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P10404 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
P10404 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P10404 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P10404 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
P10404 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P10404 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
P10404 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P10404 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
P10404 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P10404 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P10404 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P10404 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P10404 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P10404 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P10404 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC16■□□□□ 0.15
P10404 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
P10404 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
P10404 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P10404 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P10404 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P10404 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P10404 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P10404 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P10404 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P10404 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P10404 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P10404 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P10404 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P10404 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
P10404 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
P10404 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P10404 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P10404 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P10404 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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