Protein–RNA interactions for Protein: P0DP43

Catspere, Cation channel sperm-associated protein subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CatspereP0DP43 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CatspereP0DP43 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CatspereP0DP43 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CatspereP0DP43 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CatspereP0DP43 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CatspereP0DP43 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
CatspereP0DP43 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CatspereP0DP43 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CatspereP0DP43 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CatspereP0DP43 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CatspereP0DP43 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CatspereP0DP43 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CatspereP0DP43 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CatspereP0DP43 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CatspereP0DP43 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CatspereP0DP43 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CatspereP0DP43 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CatspereP0DP43 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CatspereP0DP43 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CatspereP0DP43 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CatspereP0DP43 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CatspereP0DP43 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CatspereP0DP43 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CatspereP0DP43 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CatspereP0DP43 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CatspereP0DP43 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CatspereP0DP43 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CatspereP0DP43 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CatspereP0DP43 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CatspereP0DP43 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CatspereP0DP43 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CatspereP0DP43 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CatspereP0DP43 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CatspereP0DP43 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CatspereP0DP43 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CatspereP0DP43 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CatspereP0DP43 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CatspereP0DP43 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CatspereP0DP43 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CatspereP0DP43 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CatspereP0DP43 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CatspereP0DP43 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CatspereP0DP43 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CatspereP0DP43 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CatspereP0DP43 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CatspereP0DP43 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CatspereP0DP43 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CatspereP0DP43 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CatspereP0DP43 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CatspereP0DP43 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CatspereP0DP43 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CatspereP0DP43 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CatspereP0DP43 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CatspereP0DP43 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CatspereP0DP43 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CatspereP0DP43 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CatspereP0DP43 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CatspereP0DP43 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CatspereP0DP43 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CatspereP0DP43 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CatspereP0DP43 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CatspereP0DP43 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CatspereP0DP43 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CatspereP0DP43 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CatspereP0DP43 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CatspereP0DP43 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CatspereP0DP43 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CatspereP0DP43 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CatspereP0DP43 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CatspereP0DP43 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CatspereP0DP43 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CatspereP0DP43 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CatspereP0DP43 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CatspereP0DP43 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CatspereP0DP43 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CatspereP0DP43 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CatspereP0DP43 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CatspereP0DP43 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
CatspereP0DP43 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CatspereP0DP43 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CatspereP0DP43 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CatspereP0DP43 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CatspereP0DP43 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CatspereP0DP43 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CatspereP0DP43 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CatspereP0DP43 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CatspereP0DP43 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CatspereP0DP43 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CatspereP0DP43 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CatspereP0DP43 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CatspereP0DP43 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CatspereP0DP43 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CatspereP0DP43 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CatspereP0DP43 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CatspereP0DP43 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CatspereP0DP43 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CatspereP0DP43 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CatspereP0DP43 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CatspereP0DP43 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CatspereP0DP43 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms