Protein–RNA interactions for Protein: P0DN34

Ndufb1, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 57 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufb1P0DN34 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ndufb1P0DN34 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ndufb1P0DN34 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ndufb1P0DN34 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ndufb1P0DN34 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ndufb1P0DN34 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ndufb1P0DN34 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ndufb1P0DN34 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ndufb1P0DN34 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ndufb1P0DN34 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ndufb1P0DN34 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ndufb1P0DN34 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ndufb1P0DN34 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ndufb1P0DN34 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ndufb1P0DN34 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ndufb1P0DN34 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ndufb1P0DN34 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ndufb1P0DN34 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ndufb1P0DN34 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ndufb1P0DN34 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ndufb1P0DN34 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ndufb1P0DN34 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
Ndufb1P0DN34 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ndufb1P0DN34 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ndufb1P0DN34 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ndufb1P0DN34 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ndufb1P0DN34 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ndufb1P0DN34 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ndufb1P0DN34 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ndufb1P0DN34 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ndufb1P0DN34 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ndufb1P0DN34 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ndufb1P0DN34 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ndufb1P0DN34 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ndufb1P0DN34 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ndufb1P0DN34 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ndufb1P0DN34 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ndufb1P0DN34 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ndufb1P0DN34 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ndufb1P0DN34 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ndufb1P0DN34 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ndufb1P0DN34 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ndufb1P0DN34 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ndufb1P0DN34 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ndufb1P0DN34 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ndufb1P0DN34 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ndufb1P0DN34 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ndufb1P0DN34 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ndufb1P0DN34 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ndufb1P0DN34 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ndufb1P0DN34 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ndufb1P0DN34 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ndufb1P0DN34 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ndufb1P0DN34 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ndufb1P0DN34 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ndufb1P0DN34 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ndufb1P0DN34 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ndufb1P0DN34 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ndufb1P0DN34 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ndufb1P0DN34 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ndufb1P0DN34 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Ndufb1P0DN34 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ndufb1P0DN34 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ndufb1P0DN34 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ndufb1P0DN34 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ndufb1P0DN34 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ndufb1P0DN34 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ndufb1P0DN34 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ndufb1P0DN34 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ndufb1P0DN34 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ndufb1P0DN34 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ndufb1P0DN34 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ndufb1P0DN34 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ndufb1P0DN34 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ndufb1P0DN34 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ndufb1P0DN34 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ndufb1P0DN34 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ndufb1P0DN34 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ndufb1P0DN34 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ndufb1P0DN34 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ndufb1P0DN34 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ndufb1P0DN34 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ndufb1P0DN34 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ndufb1P0DN34 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ndufb1P0DN34 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ndufb1P0DN34 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ndufb1P0DN34 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ndufb1P0DN34 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ndufb1P0DN34 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ndufb1P0DN34 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ndufb1P0DN34 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ndufb1P0DN34 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ndufb1P0DN34 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ndufb1P0DN34 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ndufb1P0DN34 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ndufb1P0DN34 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ndufb1P0DN34 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ndufb1P0DN34 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ndufb1P0DN34 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ndufb1P0DN34 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms