Protein–RNA interactions for Protein: P0C6B7

Igsf6, Immunoglobulin superfamily member 6, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igsf6P0C6B7 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Igsf6P0C6B7 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Igsf6P0C6B7 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Igsf6P0C6B7 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Igsf6P0C6B7 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Igsf6P0C6B7 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Igsf6P0C6B7 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Igsf6P0C6B7 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Igsf6P0C6B7 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Igsf6P0C6B7 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Igsf6P0C6B7 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Igsf6P0C6B7 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Igsf6P0C6B7 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Igsf6P0C6B7 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Igsf6P0C6B7 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Igsf6P0C6B7 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Igsf6P0C6B7 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Igsf6P0C6B7 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Igsf6P0C6B7 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Igsf6P0C6B7 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Igsf6P0C6B7 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Igsf6P0C6B7 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Igsf6P0C6B7 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Igsf6P0C6B7 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Igsf6P0C6B7 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Igsf6P0C6B7 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Igsf6P0C6B7 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Igsf6P0C6B7 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Igsf6P0C6B7 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Igsf6P0C6B7 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Igsf6P0C6B7 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Igsf6P0C6B7 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Igsf6P0C6B7 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Igsf6P0C6B7 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Igsf6P0C6B7 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Igsf6P0C6B7 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Igsf6P0C6B7 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Igsf6P0C6B7 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Igsf6P0C6B7 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Igsf6P0C6B7 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Igsf6P0C6B7 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Igsf6P0C6B7 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Igsf6P0C6B7 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Igsf6P0C6B7 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Igsf6P0C6B7 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Igsf6P0C6B7 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Igsf6P0C6B7 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Igsf6P0C6B7 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Igsf6P0C6B7 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Igsf6P0C6B7 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Igsf6P0C6B7 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Igsf6P0C6B7 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Igsf6P0C6B7 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Igsf6P0C6B7 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Igsf6P0C6B7 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Igsf6P0C6B7 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Igsf6P0C6B7 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Igsf6P0C6B7 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Igsf6P0C6B7 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Igsf6P0C6B7 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Igsf6P0C6B7 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Igsf6P0C6B7 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Igsf6P0C6B7 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Igsf6P0C6B7 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Igsf6P0C6B7 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Igsf6P0C6B7 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Igsf6P0C6B7 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Igsf6P0C6B7 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Igsf6P0C6B7 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Igsf6P0C6B7 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Igsf6P0C6B7 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Igsf6P0C6B7 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Igsf6P0C6B7 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Igsf6P0C6B7 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Igsf6P0C6B7 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Igsf6P0C6B7 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Igsf6P0C6B7 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Igsf6P0C6B7 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Igsf6P0C6B7 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Igsf6P0C6B7 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Igsf6P0C6B7 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Igsf6P0C6B7 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Igsf6P0C6B7 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Igsf6P0C6B7 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Igsf6P0C6B7 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Igsf6P0C6B7 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Igsf6P0C6B7 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Igsf6P0C6B7 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Igsf6P0C6B7 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Igsf6P0C6B7 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Igsf6P0C6B7 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Igsf6P0C6B7 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Igsf6P0C6B7 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Igsf6P0C6B7 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Igsf6P0C6B7 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Igsf6P0C6B7 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Igsf6P0C6B7 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Igsf6P0C6B7 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Igsf6P0C6B7 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Igsf6P0C6B7 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms