Protein–RNA interactions for Protein: P09925

Surf1, Surfeit locus protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Surf1P09925 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Surf1P09925 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Surf1P09925 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Surf1P09925 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Surf1P09925 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Surf1P09925 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Surf1P09925 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Surf1P09925 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Surf1P09925 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Surf1P09925 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Surf1P09925 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Surf1P09925 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Surf1P09925 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Surf1P09925 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Surf1P09925 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Surf1P09925 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Surf1P09925 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Surf1P09925 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Surf1P09925 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Surf1P09925 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Surf1P09925 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Surf1P09925 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Surf1P09925 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Surf1P09925 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Surf1P09925 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Surf1P09925 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Surf1P09925 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Surf1P09925 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Surf1P09925 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Surf1P09925 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Surf1P09925 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Surf1P09925 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Surf1P09925 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Surf1P09925 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Surf1P09925 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Surf1P09925 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Surf1P09925 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Surf1P09925 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Surf1P09925 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Surf1P09925 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Surf1P09925 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Surf1P09925 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Surf1P09925 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Surf1P09925 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Surf1P09925 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Surf1P09925 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Surf1P09925 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Surf1P09925 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Surf1P09925 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Surf1P09925 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Surf1P09925 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Surf1P09925 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Surf1P09925 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Surf1P09925 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Surf1P09925 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Surf1P09925 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Surf1P09925 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Surf1P09925 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Surf1P09925 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Surf1P09925 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Surf1P09925 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Surf1P09925 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Surf1P09925 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Surf1P09925 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Surf1P09925 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Surf1P09925 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Surf1P09925 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Surf1P09925 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Surf1P09925 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Surf1P09925 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Surf1P09925 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Surf1P09925 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Surf1P09925 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Surf1P09925 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Surf1P09925 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Surf1P09925 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Surf1P09925 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Surf1P09925 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Surf1P09925 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Surf1P09925 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Surf1P09925 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Surf1P09925 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Surf1P09925 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Surf1P09925 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Surf1P09925 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Surf1P09925 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Surf1P09925 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Surf1P09925 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Surf1P09925 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Surf1P09925 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Surf1P09925 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
Surf1P09925 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Surf1P09925 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Surf1P09925 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Surf1P09925 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Surf1P09925 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Surf1P09925 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Surf1P09925 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Surf1P09925 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Surf1P09925 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms