Protein–RNA interactions for Protein: P08226

Apoe, Apolipoprotein E, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApoeP08226 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ApoeP08226 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ApoeP08226 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ApoeP08226 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ApoeP08226 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ApoeP08226 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ApoeP08226 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ApoeP08226 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ApoeP08226 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ApoeP08226 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
ApoeP08226 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ApoeP08226 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ApoeP08226 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
ApoeP08226 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ApoeP08226 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ApoeP08226 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ApoeP08226 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ApoeP08226 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ApoeP08226 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ApoeP08226 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ApoeP08226 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ApoeP08226 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ApoeP08226 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
ApoeP08226 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ApoeP08226 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ApoeP08226 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ApoeP08226 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ApoeP08226 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ApoeP08226 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ApoeP08226 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ApoeP08226 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ApoeP08226 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ApoeP08226 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ApoeP08226 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ApoeP08226 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ApoeP08226 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ApoeP08226 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ApoeP08226 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ApoeP08226 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ApoeP08226 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ApoeP08226 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ApoeP08226 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ApoeP08226 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ApoeP08226 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ApoeP08226 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ApoeP08226 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ApoeP08226 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ApoeP08226 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ApoeP08226 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ApoeP08226 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ApoeP08226 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ApoeP08226 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ApoeP08226 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ApoeP08226 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ApoeP08226 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ApoeP08226 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ApoeP08226 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ApoeP08226 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ApoeP08226 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ApoeP08226 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ApoeP08226 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ApoeP08226 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ApoeP08226 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ApoeP08226 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ApoeP08226 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ApoeP08226 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ApoeP08226 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ApoeP08226 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ApoeP08226 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ApoeP08226 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ApoeP08226 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ApoeP08226 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ApoeP08226 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ApoeP08226 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ApoeP08226 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ApoeP08226 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ApoeP08226 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ApoeP08226 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ApoeP08226 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ApoeP08226 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ApoeP08226 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ApoeP08226 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ApoeP08226 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ApoeP08226 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ApoeP08226 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ApoeP08226 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ApoeP08226 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ApoeP08226 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ApoeP08226 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ApoeP08226 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ApoeP08226 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ApoeP08226 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ApoeP08226 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ApoeP08226 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ApoeP08226 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ApoeP08226 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ApoeP08226 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ApoeP08226 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ApoeP08226 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ApoeP08226 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms