Protein–RNA interactions for Protein: P05367

Saa2, Serum amyloid A-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 122 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Saa2P05367 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Saa2P05367 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Saa2P05367 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Saa2P05367 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Saa2P05367 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Saa2P05367 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Saa2P05367 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Saa2P05367 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Saa2P05367 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Saa2P05367 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Saa2P05367 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Saa2P05367 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Saa2P05367 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Saa2P05367 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Saa2P05367 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Saa2P05367 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Saa2P05367 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Saa2P05367 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Saa2P05367 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Saa2P05367 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Saa2P05367 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Saa2P05367 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Saa2P05367 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Saa2P05367 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Saa2P05367 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Saa2P05367 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Saa2P05367 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Saa2P05367 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Saa2P05367 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Saa2P05367 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Saa2P05367 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Saa2P05367 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Saa2P05367 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Saa2P05367 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Saa2P05367 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Saa2P05367 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Saa2P05367 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Saa2P05367 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Saa2P05367 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Saa2P05367 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Saa2P05367 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Saa2P05367 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Saa2P05367 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Saa2P05367 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Saa2P05367 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Saa2P05367 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Saa2P05367 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Saa2P05367 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Saa2P05367 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Saa2P05367 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Saa2P05367 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Saa2P05367 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Saa2P05367 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Saa2P05367 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Saa2P05367 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Saa2P05367 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Saa2P05367 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Saa2P05367 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Saa2P05367 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Saa2P05367 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Saa2P05367 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Saa2P05367 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Saa2P05367 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Saa2P05367 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Saa2P05367 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Saa2P05367 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Saa2P05367 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Saa2P05367 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Saa2P05367 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Saa2P05367 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Saa2P05367 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Saa2P05367 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Saa2P05367 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Saa2P05367 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Saa2P05367 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Saa2P05367 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Saa2P05367 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Saa2P05367 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Saa2P05367 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Saa2P05367 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Saa2P05367 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Saa2P05367 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Saa2P05367 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Saa2P05367 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Saa2P05367 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Saa2P05367 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Saa2P05367 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Saa2P05367 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Saa2P05367 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Saa2P05367 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Saa2P05367 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Saa2P05367 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Saa2P05367 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Saa2P05367 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Saa2P05367 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Saa2P05367 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Saa2P05367 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Saa2P05367 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Saa2P05367 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Saa2P05367 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms