Protein–RNA interactions for Protein: P01921

H2-Ab1, H-2 class II histocompatibility antigen, A-D beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Ab1P01921 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
H2-Ab1P01921 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
H2-Ab1P01921 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
H2-Ab1P01921 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
H2-Ab1P01921 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
H2-Ab1P01921 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
H2-Ab1P01921 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
H2-Ab1P01921 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
H2-Ab1P01921 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
H2-Ab1P01921 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
H2-Ab1P01921 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
H2-Ab1P01921 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
H2-Ab1P01921 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
H2-Ab1P01921 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
H2-Ab1P01921 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
H2-Ab1P01921 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
H2-Ab1P01921 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
H2-Ab1P01921 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
H2-Ab1P01921 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
H2-Ab1P01921 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
H2-Ab1P01921 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
H2-Ab1P01921 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
H2-Ab1P01921 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
H2-Ab1P01921 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
H2-Ab1P01921 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
H2-Ab1P01921 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
H2-Ab1P01921 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
H2-Ab1P01921 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
H2-Ab1P01921 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
H2-Ab1P01921 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
H2-Ab1P01921 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
H2-Ab1P01921 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
H2-Ab1P01921 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
H2-Ab1P01921 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
H2-Ab1P01921 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
H2-Ab1P01921 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2-Ab1P01921 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2-Ab1P01921 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2-Ab1P01921 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2-Ab1P01921 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2-Ab1P01921 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2-Ab1P01921 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2-Ab1P01921 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
H2-Ab1P01921 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2-Ab1P01921 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2-Ab1P01921 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2-Ab1P01921 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2-Ab1P01921 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2-Ab1P01921 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2-Ab1P01921 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2-Ab1P01921 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2-Ab1P01921 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2-Ab1P01921 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2-Ab1P01921 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2-Ab1P01921 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2-Ab1P01921 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2-Ab1P01921 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2-Ab1P01921 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2-Ab1P01921 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2-Ab1P01921 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2-Ab1P01921 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2-Ab1P01921 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2-Ab1P01921 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2-Ab1P01921 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2-Ab1P01921 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
H2-Ab1P01921 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2-Ab1P01921 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2-Ab1P01921 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2-Ab1P01921 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2-Ab1P01921 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2-Ab1P01921 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2-Ab1P01921 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2-Ab1P01921 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2-Ab1P01921 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2-Ab1P01921 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2-Ab1P01921 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2-Ab1P01921 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2-Ab1P01921 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2-Ab1P01921 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2-Ab1P01921 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2-Ab1P01921 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2-Ab1P01921 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2-Ab1P01921 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2-Ab1P01921 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2-Ab1P01921 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2-Ab1P01921 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2-Ab1P01921 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2-Ab1P01921 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2-Ab1P01921 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2-Ab1P01921 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2-Ab1P01921 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2-Ab1P01921 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2-Ab1P01921 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2-Ab1P01921 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
H2-Ab1P01921 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2-Ab1P01921 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2-Ab1P01921 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2-Ab1P01921 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2-Ab1P01921 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2-Ab1P01921 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms