Protein–RNA interactions for Protein: P01800

Ig heavy chain V-III region T957, mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01800 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01800 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01800 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01800 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01800 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01800 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01800 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01800 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01800 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01800 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01800 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01800 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01800 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01800 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01800 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01800 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01800 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01800 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01800 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01800 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01800 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01800 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01800 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01800 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01800 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01800 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01800 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
P01800 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01800 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01800 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01800 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01800 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01800 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01800 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01800 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01800 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01800 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01800 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01800 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01800 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01800 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01800 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01800 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01800 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01800 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01800 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
P01800 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01800 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01800 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01800 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01800 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01800 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01800 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01800 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01800 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01800 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01800 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01800 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01800 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01800 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01800 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01800 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01800 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01800 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01800 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
P01800 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01800 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01800 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01800 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01800 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01800 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01800 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01800 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01800 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01800 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01800 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01800 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01800 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01800 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
P01800 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
P01800 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01800 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01800 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01800 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01800 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01800 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01800 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01800 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01800 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01800 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01800 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01800 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01800 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01800 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01800 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01800 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01800 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01800 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01800 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01800 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms