Protein–RNA interactions for Protein: P01676

Ig kappa chain V-VI region XRPC 24, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01676 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
P01676 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
P01676 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
P01676 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
P01676 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
P01676 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
P01676 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
P01676 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
P01676 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
P01676 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
P01676 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
P01676 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
P01676 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
P01676 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
P01676 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
P01676 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
P01676 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
P01676 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
P01676 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
P01676 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
P01676 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
P01676 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
P01676 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
P01676 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
P01676 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
P01676 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
P01676 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
P01676 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
P01676 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
P01676 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
P01676 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
P01676 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
P01676 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
P01676 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
P01676 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
P01676 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
P01676 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
P01676 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
P01676 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
P01676 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
P01676 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
P01676 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
P01676 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
P01676 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
P01676 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
P01676 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
P01676 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
P01676 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
P01676 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
P01676 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
P01676 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
P01676 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
P01676 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
P01676 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
P01676 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
P01676 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
P01676 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
P01676 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
P01676 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
P01676 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
P01676 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
P01676 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
P01676 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
P01676 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
P01676 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
P01676 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
P01676 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
P01676 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
P01676 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
P01676 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
P01676 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
P01676 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
P01676 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
P01676 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
P01676 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
P01676 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
P01676 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
P01676 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
P01676 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
P01676 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
P01676 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
P01676 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
P01676 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
P01676 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
P01676 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
P01676 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
P01676 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
P01676 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
P01676 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
P01676 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
P01676 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
P01676 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
P01676 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
P01676 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
P01676 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
P01676 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
P01676 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
P01676 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
P01676 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
P01676 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms