Protein–RNA interactions for Protein: P01665

Ig kappa chain V-III region PC 7043, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01665 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
P01665 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
P01665 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
P01665 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
P01665 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
P01665 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
P01665 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
P01665 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
P01665 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
P01665 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
P01665 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
P01665 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
P01665 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
P01665 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
P01665 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
P01665 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
P01665 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
P01665 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
P01665 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
P01665 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
P01665 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
P01665 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
P01665 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
P01665 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
P01665 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
P01665 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
P01665 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
P01665 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
P01665 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
P01665 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
P01665 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
P01665 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
P01665 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
P01665 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
P01665 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
P01665 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
P01665 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
P01665 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
P01665 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
P01665 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
P01665 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
P01665 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
P01665 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
P01665 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
P01665 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
P01665 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
P01665 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
P01665 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
P01665 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
P01665 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
P01665 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
P01665 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
P01665 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
P01665 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
P01665 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
P01665 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
P01665 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
P01665 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
P01665 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
P01665 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
P01665 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
P01665 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
P01665 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
P01665 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
P01665 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01665 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01665 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01665 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01665 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01665 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01665 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01665 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01665 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01665 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01665 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01665 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01665 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
P01665 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01665 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01665 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01665 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01665 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01665 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01665 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01665 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01665 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01665 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01665 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01665 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01665 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01665 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01665 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01665 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01665 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
P01665 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
P01665 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
P01665 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
P01665 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
P01665 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
P01665 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms