Protein–RNA interactions for Protein: P01658

Ig kappa chain V-III region MOPC 321, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01658 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01658 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01658 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01658 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01658 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01658 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01658 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01658 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01658 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
P01658 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
P01658 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01658 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01658 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01658 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
P01658 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01658 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01658 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01658 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01658 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01658 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01658 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01658 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01658 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01658 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01658 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01658 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01658 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01658 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01658 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01658 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01658 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01658 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01658 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01658 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01658 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
P01658 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01658 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01658 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01658 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01658 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01658 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01658 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01658 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01658 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
P01658 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
P01658 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01658 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01658 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01658 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
P01658 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
P01658 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01658 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
P01658 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01658 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
P01658 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01658 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01658 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01658 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01658 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01658 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01658 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
P01658 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01658 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01658 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01658 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01658 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01658 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01658 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01658 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01658 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01658 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01658 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01658 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01658 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01658 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01658 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01658 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01658 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01658 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01658 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01658 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01658 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01658 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01658 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01658 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
P01658 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01658 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
P01658 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01658 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01658 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01658 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01658 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01658 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01658 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01658 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01658 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01658 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01658 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01658 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01658 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms