Protein–RNA interactions for Protein: O88838

Spsb2, SPRY domain-containing SOCS box protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spsb2O88838 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Spsb2O88838 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Spsb2O88838 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Spsb2O88838 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Spsb2O88838 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Spsb2O88838 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Spsb2O88838 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Spsb2O88838 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Spsb2O88838 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Spsb2O88838 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Spsb2O88838 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Spsb2O88838 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Spsb2O88838 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Spsb2O88838 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Spsb2O88838 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Spsb2O88838 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Spsb2O88838 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Spsb2O88838 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Spsb2O88838 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Spsb2O88838 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Spsb2O88838 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Spsb2O88838 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Spsb2O88838 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Spsb2O88838 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Spsb2O88838 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Spsb2O88838 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Spsb2O88838 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Spsb2O88838 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Spsb2O88838 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Spsb2O88838 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Spsb2O88838 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Spsb2O88838 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Spsb2O88838 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Spsb2O88838 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Spsb2O88838 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Spsb2O88838 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Spsb2O88838 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Spsb2O88838 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Spsb2O88838 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Spsb2O88838 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Spsb2O88838 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Spsb2O88838 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Spsb2O88838 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Spsb2O88838 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Spsb2O88838 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Spsb2O88838 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Spsb2O88838 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Spsb2O88838 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Spsb2O88838 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Spsb2O88838 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Spsb2O88838 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Spsb2O88838 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Spsb2O88838 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Spsb2O88838 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Spsb2O88838 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Spsb2O88838 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Spsb2O88838 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Spsb2O88838 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Spsb2O88838 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Spsb2O88838 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Spsb2O88838 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spsb2O88838 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spsb2O88838 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spsb2O88838 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spsb2O88838 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spsb2O88838 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spsb2O88838 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spsb2O88838 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spsb2O88838 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spsb2O88838 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Spsb2O88838 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Spsb2O88838 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Spsb2O88838 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Spsb2O88838 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Spsb2O88838 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Spsb2O88838 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Spsb2O88838 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Spsb2O88838 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Spsb2O88838 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Spsb2O88838 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Spsb2O88838 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Spsb2O88838 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Spsb2O88838 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Spsb2O88838 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Spsb2O88838 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Spsb2O88838 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Spsb2O88838 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Spsb2O88838 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Spsb2O88838 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Spsb2O88838 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Spsb2O88838 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Spsb2O88838 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Spsb2O88838 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Spsb2O88838 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Spsb2O88838 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Spsb2O88838 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Spsb2O88838 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Spsb2O88838 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Spsb2O88838 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Spsb2O88838 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms