Protein–RNA interactions for Protein: O88728

Ifitm5, Interferon-induced transmembrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifitm5O88728 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifitm5O88728 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifitm5O88728 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifitm5O88728 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifitm5O88728 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifitm5O88728 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifitm5O88728 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifitm5O88728 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifitm5O88728 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifitm5O88728 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifitm5O88728 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifitm5O88728 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifitm5O88728 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifitm5O88728 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifitm5O88728 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifitm5O88728 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifitm5O88728 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifitm5O88728 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifitm5O88728 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifitm5O88728 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifitm5O88728 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifitm5O88728 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifitm5O88728 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifitm5O88728 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifitm5O88728 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifitm5O88728 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifitm5O88728 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifitm5O88728 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifitm5O88728 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifitm5O88728 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifitm5O88728 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifitm5O88728 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifitm5O88728 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifitm5O88728 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifitm5O88728 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifitm5O88728 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifitm5O88728 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifitm5O88728 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifitm5O88728 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifitm5O88728 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifitm5O88728 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifitm5O88728 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifitm5O88728 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifitm5O88728 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifitm5O88728 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifitm5O88728 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifitm5O88728 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifitm5O88728 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifitm5O88728 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifitm5O88728 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifitm5O88728 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifitm5O88728 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifitm5O88728 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifitm5O88728 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifitm5O88728 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifitm5O88728 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifitm5O88728 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifitm5O88728 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifitm5O88728 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifitm5O88728 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifitm5O88728 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifitm5O88728 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifitm5O88728 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifitm5O88728 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifitm5O88728 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifitm5O88728 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifitm5O88728 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifitm5O88728 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifitm5O88728 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifitm5O88728 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifitm5O88728 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifitm5O88728 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifitm5O88728 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifitm5O88728 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifitm5O88728 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifitm5O88728 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifitm5O88728 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifitm5O88728 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifitm5O88728 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifitm5O88728 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifitm5O88728 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifitm5O88728 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifitm5O88728 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifitm5O88728 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifitm5O88728 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifitm5O88728 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifitm5O88728 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifitm5O88728 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifitm5O88728 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifitm5O88728 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifitm5O88728 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifitm5O88728 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifitm5O88728 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifitm5O88728 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifitm5O88728 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifitm5O88728 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifitm5O88728 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifitm5O88728 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifitm5O88728 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifitm5O88728 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms