Protein–RNA interactions for Protein: O88705

Hcn3, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 3, mousemouse

Predictions only

Length 779 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcn3O88705 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hcn3O88705 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hcn3O88705 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Hcn3O88705 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hcn3O88705 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hcn3O88705 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hcn3O88705 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hcn3O88705 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hcn3O88705 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hcn3O88705 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hcn3O88705 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hcn3O88705 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hcn3O88705 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hcn3O88705 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hcn3O88705 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hcn3O88705 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hcn3O88705 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hcn3O88705 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hcn3O88705 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hcn3O88705 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hcn3O88705 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hcn3O88705 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hcn3O88705 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hcn3O88705 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hcn3O88705 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hcn3O88705 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hcn3O88705 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hcn3O88705 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hcn3O88705 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hcn3O88705 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hcn3O88705 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hcn3O88705 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hcn3O88705 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hcn3O88705 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hcn3O88705 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hcn3O88705 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hcn3O88705 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hcn3O88705 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hcn3O88705 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hcn3O88705 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hcn3O88705 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hcn3O88705 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hcn3O88705 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Hcn3O88705 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hcn3O88705 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hcn3O88705 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hcn3O88705 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hcn3O88705 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hcn3O88705 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Hcn3O88705 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hcn3O88705 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hcn3O88705 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hcn3O88705 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hcn3O88705 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hcn3O88705 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hcn3O88705 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hcn3O88705 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hcn3O88705 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hcn3O88705 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hcn3O88705 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hcn3O88705 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hcn3O88705 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hcn3O88705 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hcn3O88705 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hcn3O88705 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hcn3O88705 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Hcn3O88705 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Hcn3O88705 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Hcn3O88705 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Hcn3O88705 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Hcn3O88705 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Hcn3O88705 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hcn3O88705 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Hcn3O88705 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hcn3O88705 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hcn3O88705 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hcn3O88705 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hcn3O88705 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hcn3O88705 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hcn3O88705 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hcn3O88705 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hcn3O88705 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hcn3O88705 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hcn3O88705 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hcn3O88705 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hcn3O88705 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hcn3O88705 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hcn3O88705 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hcn3O88705 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hcn3O88705 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hcn3O88705 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hcn3O88705 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hcn3O88705 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hcn3O88705 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hcn3O88705 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hcn3O88705 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hcn3O88705 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hcn3O88705 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hcn3O88705 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Hcn3O88705 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms