Protein–RNA interactions for Protein: O88507

Cntfr, Ciliary neurotrophic factor receptor subunit alpha, mousemouse

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CntfrO88507 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CntfrO88507 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CntfrO88507 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CntfrO88507 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CntfrO88507 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CntfrO88507 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CntfrO88507 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CntfrO88507 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CntfrO88507 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CntfrO88507 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CntfrO88507 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CntfrO88507 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CntfrO88507 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CntfrO88507 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CntfrO88507 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CntfrO88507 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CntfrO88507 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CntfrO88507 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CntfrO88507 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CntfrO88507 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CntfrO88507 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CntfrO88507 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CntfrO88507 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CntfrO88507 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CntfrO88507 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CntfrO88507 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CntfrO88507 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CntfrO88507 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CntfrO88507 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CntfrO88507 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CntfrO88507 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CntfrO88507 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CntfrO88507 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CntfrO88507 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CntfrO88507 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CntfrO88507 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CntfrO88507 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CntfrO88507 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CntfrO88507 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CntfrO88507 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CntfrO88507 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CntfrO88507 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CntfrO88507 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CntfrO88507 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CntfrO88507 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CntfrO88507 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CntfrO88507 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CntfrO88507 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CntfrO88507 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CntfrO88507 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CntfrO88507 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CntfrO88507 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CntfrO88507 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CntfrO88507 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CntfrO88507 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CntfrO88507 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CntfrO88507 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CntfrO88507 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CntfrO88507 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CntfrO88507 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CntfrO88507 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CntfrO88507 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CntfrO88507 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CntfrO88507 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CntfrO88507 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CntfrO88507 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CntfrO88507 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CntfrO88507 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CntfrO88507 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CntfrO88507 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CntfrO88507 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CntfrO88507 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CntfrO88507 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CntfrO88507 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CntfrO88507 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CntfrO88507 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CntfrO88507 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CntfrO88507 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CntfrO88507 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CntfrO88507 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CntfrO88507 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CntfrO88507 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CntfrO88507 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CntfrO88507 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CntfrO88507 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CntfrO88507 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CntfrO88507 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CntfrO88507 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CntfrO88507 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CntfrO88507 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CntfrO88507 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CntfrO88507 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CntfrO88507 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CntfrO88507 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CntfrO88507 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CntfrO88507 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CntfrO88507 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CntfrO88507 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CntfrO88507 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CntfrO88507 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
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