Protein–RNA interactions for Protein: O88384

Vti1b, Vesicle transport through interaction with t-SNAREs homolog 1B, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vti1bO88384 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vti1bO88384 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vti1bO88384 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vti1bO88384 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vti1bO88384 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vti1bO88384 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vti1bO88384 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vti1bO88384 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vti1bO88384 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Vti1bO88384 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vti1bO88384 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vti1bO88384 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vti1bO88384 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vti1bO88384 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vti1bO88384 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vti1bO88384 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vti1bO88384 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vti1bO88384 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vti1bO88384 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vti1bO88384 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vti1bO88384 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vti1bO88384 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vti1bO88384 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vti1bO88384 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vti1bO88384 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vti1bO88384 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vti1bO88384 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vti1bO88384 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vti1bO88384 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Vti1bO88384 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Vti1bO88384 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vti1bO88384 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vti1bO88384 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vti1bO88384 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vti1bO88384 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vti1bO88384 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vti1bO88384 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vti1bO88384 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vti1bO88384 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vti1bO88384 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vti1bO88384 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vti1bO88384 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vti1bO88384 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vti1bO88384 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vti1bO88384 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vti1bO88384 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vti1bO88384 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vti1bO88384 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vti1bO88384 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vti1bO88384 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vti1bO88384 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vti1bO88384 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vti1bO88384 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vti1bO88384 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vti1bO88384 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vti1bO88384 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vti1bO88384 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vti1bO88384 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vti1bO88384 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vti1bO88384 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vti1bO88384 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vti1bO88384 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vti1bO88384 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vti1bO88384 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vti1bO88384 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vti1bO88384 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vti1bO88384 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vti1bO88384 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vti1bO88384 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vti1bO88384 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Vti1bO88384 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vti1bO88384 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vti1bO88384 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vti1bO88384 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vti1bO88384 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vti1bO88384 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vti1bO88384 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vti1bO88384 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vti1bO88384 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Vti1bO88384 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Vti1bO88384 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vti1bO88384 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vti1bO88384 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vti1bO88384 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vti1bO88384 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vti1bO88384 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vti1bO88384 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vti1bO88384 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vti1bO88384 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vti1bO88384 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vti1bO88384 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Vti1bO88384 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vti1bO88384 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vti1bO88384 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vti1bO88384 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vti1bO88384 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vti1bO88384 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vti1bO88384 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vti1bO88384 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vti1bO88384 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms