Protein–RNA interactions for Protein: O70174

Chrna4, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna4O70174 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Chrna4O70174 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Chrna4O70174 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Chrna4O70174 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Chrna4O70174 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Chrna4O70174 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Chrna4O70174 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Chrna4O70174 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Chrna4O70174 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Chrna4O70174 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Chrna4O70174 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Chrna4O70174 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Chrna4O70174 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Chrna4O70174 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Chrna4O70174 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Chrna4O70174 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Chrna4O70174 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Chrna4O70174 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Chrna4O70174 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Chrna4O70174 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Chrna4O70174 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Chrna4O70174 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Chrna4O70174 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Chrna4O70174 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Chrna4O70174 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Chrna4O70174 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Chrna4O70174 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Chrna4O70174 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Chrna4O70174 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Chrna4O70174 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Chrna4O70174 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Chrna4O70174 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Chrna4O70174 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Chrna4O70174 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Chrna4O70174 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Chrna4O70174 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Chrna4O70174 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Chrna4O70174 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Chrna4O70174 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Chrna4O70174 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Chrna4O70174 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Chrna4O70174 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Chrna4O70174 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Chrna4O70174 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Chrna4O70174 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Chrna4O70174 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Chrna4O70174 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Chrna4O70174 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Chrna4O70174 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Chrna4O70174 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Chrna4O70174 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Chrna4O70174 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Chrna4O70174 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Chrna4O70174 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Chrna4O70174 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Chrna4O70174 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Chrna4O70174 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Chrna4O70174 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Chrna4O70174 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Chrna4O70174 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Chrna4O70174 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Chrna4O70174 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Chrna4O70174 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Chrna4O70174 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Chrna4O70174 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Chrna4O70174 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Chrna4O70174 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Chrna4O70174 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Chrna4O70174 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Chrna4O70174 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Chrna4O70174 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Chrna4O70174 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Chrna4O70174 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Chrna4O70174 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Chrna4O70174 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Chrna4O70174 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Chrna4O70174 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Chrna4O70174 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Chrna4O70174 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Chrna4O70174 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Chrna4O70174 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Chrna4O70174 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Chrna4O70174 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Chrna4O70174 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Chrna4O70174 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Chrna4O70174 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Chrna4O70174 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Chrna4O70174 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Chrna4O70174 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Chrna4O70174 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Chrna4O70174 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Chrna4O70174 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Chrna4O70174 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Chrna4O70174 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Chrna4O70174 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Chrna4O70174 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Chrna4O70174 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Chrna4O70174 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Chrna4O70174 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Chrna4O70174 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms