Protein–RNA interactions for Protein: O55234

Psmb5, Proteasome subunit beta type-5, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb5O55234 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Psmb5O55234 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Psmb5O55234 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Psmb5O55234 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Psmb5O55234 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Psmb5O55234 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Psmb5O55234 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Psmb5O55234 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Psmb5O55234 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Psmb5O55234 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Psmb5O55234 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Psmb5O55234 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Psmb5O55234 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Psmb5O55234 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Psmb5O55234 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Psmb5O55234 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Psmb5O55234 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Psmb5O55234 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Psmb5O55234 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Psmb5O55234 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Psmb5O55234 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Psmb5O55234 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Psmb5O55234 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Psmb5O55234 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Psmb5O55234 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Psmb5O55234 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Psmb5O55234 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Psmb5O55234 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Psmb5O55234 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Psmb5O55234 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Psmb5O55234 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Psmb5O55234 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Psmb5O55234 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Psmb5O55234 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Psmb5O55234 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Psmb5O55234 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Psmb5O55234 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Psmb5O55234 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Psmb5O55234 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Psmb5O55234 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Psmb5O55234 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Psmb5O55234 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Psmb5O55234 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Psmb5O55234 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Psmb5O55234 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Psmb5O55234 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Psmb5O55234 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Psmb5O55234 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Psmb5O55234 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Psmb5O55234 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Psmb5O55234 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Psmb5O55234 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Psmb5O55234 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Psmb5O55234 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Psmb5O55234 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Psmb5O55234 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Psmb5O55234 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Psmb5O55234 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Psmb5O55234 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Psmb5O55234 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Psmb5O55234 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Psmb5O55234 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Psmb5O55234 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Psmb5O55234 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Psmb5O55234 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Psmb5O55234 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Psmb5O55234 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Psmb5O55234 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Psmb5O55234 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Psmb5O55234 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Psmb5O55234 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Psmb5O55234 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Psmb5O55234 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Psmb5O55234 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Psmb5O55234 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Psmb5O55234 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Psmb5O55234 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Psmb5O55234 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Psmb5O55234 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Psmb5O55234 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Psmb5O55234 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Psmb5O55234 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Psmb5O55234 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Psmb5O55234 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Psmb5O55234 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Psmb5O55234 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Psmb5O55234 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Psmb5O55234 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Psmb5O55234 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Psmb5O55234 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Psmb5O55234 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Psmb5O55234 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Psmb5O55234 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Psmb5O55234 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Psmb5O55234 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Psmb5O55234 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Psmb5O55234 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Psmb5O55234 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Psmb5O55234 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Psmb5O55234 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms