Protein–RNA interactions for Protein: O55144

Tlx3, T-cell leukemia homeobox protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlx3O55144 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tlx3O55144 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tlx3O55144 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Tlx3O55144 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tlx3O55144 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tlx3O55144 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tlx3O55144 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tlx3O55144 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tlx3O55144 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tlx3O55144 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tlx3O55144 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tlx3O55144 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tlx3O55144 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tlx3O55144 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Tlx3O55144 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tlx3O55144 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tlx3O55144 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Tlx3O55144 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tlx3O55144 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tlx3O55144 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tlx3O55144 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Tlx3O55144 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tlx3O55144 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tlx3O55144 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tlx3O55144 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tlx3O55144 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tlx3O55144 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Tlx3O55144 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tlx3O55144 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tlx3O55144 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tlx3O55144 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tlx3O55144 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tlx3O55144 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tlx3O55144 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tlx3O55144 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Tlx3O55144 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tlx3O55144 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tlx3O55144 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tlx3O55144 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Tlx3O55144 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tlx3O55144 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tlx3O55144 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tlx3O55144 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tlx3O55144 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tlx3O55144 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tlx3O55144 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tlx3O55144 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tlx3O55144 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Tlx3O55144 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tlx3O55144 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tlx3O55144 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tlx3O55144 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tlx3O55144 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tlx3O55144 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tlx3O55144 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tlx3O55144 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tlx3O55144 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tlx3O55144 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Tlx3O55144 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tlx3O55144 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tlx3O55144 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tlx3O55144 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tlx3O55144 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tlx3O55144 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tlx3O55144 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tlx3O55144 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tlx3O55144 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tlx3O55144 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tlx3O55144 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tlx3O55144 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tlx3O55144 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tlx3O55144 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tlx3O55144 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tlx3O55144 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tlx3O55144 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tlx3O55144 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tlx3O55144 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tlx3O55144 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tlx3O55144 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tlx3O55144 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tlx3O55144 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tlx3O55144 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tlx3O55144 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tlx3O55144 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tlx3O55144 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tlx3O55144 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tlx3O55144 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tlx3O55144 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tlx3O55144 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tlx3O55144 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tlx3O55144 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tlx3O55144 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tlx3O55144 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tlx3O55144 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tlx3O55144 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tlx3O55144 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tlx3O55144 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tlx3O55144 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tlx3O55144 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tlx3O55144 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms