Protein–RNA interactions for Protein: O55123

Mmp10, Stromelysin-2, mousemouse

Predictions only

Length 476 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp10O55123 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Mmp10O55123 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Mmp10O55123 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Mmp10O55123 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Mmp10O55123 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Mmp10O55123 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Mmp10O55123 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Mmp10O55123 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Mmp10O55123 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Mmp10O55123 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Mmp10O55123 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Mmp10O55123 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Mmp10O55123 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Mmp10O55123 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Mmp10O55123 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Mmp10O55123 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Mmp10O55123 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Mmp10O55123 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Mmp10O55123 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Mmp10O55123 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Mmp10O55123 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Mmp10O55123 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Mmp10O55123 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Mmp10O55123 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Mmp10O55123 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Mmp10O55123 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Mmp10O55123 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Mmp10O55123 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Mmp10O55123 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Mmp10O55123 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Mmp10O55123 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Mmp10O55123 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Mmp10O55123 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Mmp10O55123 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Mmp10O55123 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Mmp10O55123 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Mmp10O55123 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Mmp10O55123 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Mmp10O55123 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Mmp10O55123 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Mmp10O55123 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Mmp10O55123 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Mmp10O55123 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Mmp10O55123 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Mmp10O55123 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Mmp10O55123 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Mmp10O55123 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Mmp10O55123 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Mmp10O55123 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Mmp10O55123 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Mmp10O55123 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Mmp10O55123 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Mmp10O55123 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Mmp10O55123 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Mmp10O55123 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Mmp10O55123 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Mmp10O55123 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Mmp10O55123 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Mmp10O55123 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Mmp10O55123 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Mmp10O55123 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Mmp10O55123 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Mmp10O55123 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Mmp10O55123 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Mmp10O55123 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Mmp10O55123 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Mmp10O55123 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Mmp10O55123 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Mmp10O55123 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Mmp10O55123 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Mmp10O55123 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Mmp10O55123 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Mmp10O55123 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Mmp10O55123 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Mmp10O55123 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Mmp10O55123 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Mmp10O55123 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Mmp10O55123 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Mmp10O55123 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Mmp10O55123 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Mmp10O55123 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Mmp10O55123 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Mmp10O55123 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Mmp10O55123 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Mmp10O55123 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Mmp10O55123 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Mmp10O55123 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Mmp10O55123 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Mmp10O55123 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Mmp10O55123 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Mmp10O55123 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Mmp10O55123 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Mmp10O55123 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Mmp10O55123 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Mmp10O55123 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Mmp10O55123 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Mmp10O55123 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Mmp10O55123 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Mmp10O55123 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Mmp10O55123 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms