Protein–RNA interactions for Protein: O55029

Copb2, Coatomer subunit beta', mousemouse

Predictions only

Length 905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copb2O55029 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Copb2O55029 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Copb2O55029 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Copb2O55029 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Copb2O55029 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Copb2O55029 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Copb2O55029 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Copb2O55029 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Copb2O55029 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Copb2O55029 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Copb2O55029 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Copb2O55029 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Copb2O55029 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Copb2O55029 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Copb2O55029 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Copb2O55029 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Copb2O55029 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Copb2O55029 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Copb2O55029 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Copb2O55029 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Copb2O55029 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Copb2O55029 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Copb2O55029 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Copb2O55029 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Copb2O55029 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Copb2O55029 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Copb2O55029 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Copb2O55029 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Copb2O55029 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Copb2O55029 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Copb2O55029 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Copb2O55029 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Copb2O55029 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Copb2O55029 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Copb2O55029 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Copb2O55029 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Copb2O55029 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Copb2O55029 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Copb2O55029 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Copb2O55029 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Copb2O55029 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Copb2O55029 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Copb2O55029 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Copb2O55029 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Copb2O55029 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Copb2O55029 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Copb2O55029 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Copb2O55029 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Copb2O55029 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Copb2O55029 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Copb2O55029 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Copb2O55029 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Copb2O55029 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Copb2O55029 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Copb2O55029 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Copb2O55029 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Copb2O55029 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Copb2O55029 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Copb2O55029 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Copb2O55029 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Copb2O55029 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Copb2O55029 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Copb2O55029 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Copb2O55029 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Copb2O55029 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Copb2O55029 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Copb2O55029 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Copb2O55029 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Copb2O55029 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Copb2O55029 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Copb2O55029 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Copb2O55029 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Copb2O55029 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Copb2O55029 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Copb2O55029 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Copb2O55029 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Copb2O55029 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Copb2O55029 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Copb2O55029 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Copb2O55029 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Copb2O55029 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Copb2O55029 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Copb2O55029 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Copb2O55029 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Copb2O55029 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Copb2O55029 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Copb2O55029 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Copb2O55029 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Copb2O55029 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Copb2O55029 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Copb2O55029 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Copb2O55029 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Copb2O55029 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Copb2O55029 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Copb2O55029 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Copb2O55029 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Copb2O55029 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Copb2O55029 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Copb2O55029 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Copb2O55029 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms