Protein–RNA interactions for Protein: O55013

Trappc3, Trafficking protein particle complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc3O55013 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trappc3O55013 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trappc3O55013 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trappc3O55013 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trappc3O55013 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trappc3O55013 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trappc3O55013 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trappc3O55013 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trappc3O55013 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trappc3O55013 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trappc3O55013 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trappc3O55013 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trappc3O55013 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trappc3O55013 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trappc3O55013 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trappc3O55013 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trappc3O55013 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trappc3O55013 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trappc3O55013 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trappc3O55013 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trappc3O55013 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trappc3O55013 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trappc3O55013 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Trappc3O55013 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trappc3O55013 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trappc3O55013 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trappc3O55013 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Trappc3O55013 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trappc3O55013 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trappc3O55013 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trappc3O55013 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trappc3O55013 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trappc3O55013 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trappc3O55013 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trappc3O55013 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trappc3O55013 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trappc3O55013 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trappc3O55013 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trappc3O55013 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trappc3O55013 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trappc3O55013 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trappc3O55013 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trappc3O55013 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trappc3O55013 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trappc3O55013 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trappc3O55013 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trappc3O55013 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trappc3O55013 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Trappc3O55013 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trappc3O55013 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trappc3O55013 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trappc3O55013 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trappc3O55013 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trappc3O55013 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trappc3O55013 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trappc3O55013 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trappc3O55013 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trappc3O55013 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Trappc3O55013 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trappc3O55013 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trappc3O55013 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Trappc3O55013 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trappc3O55013 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trappc3O55013 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Trappc3O55013 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trappc3O55013 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trappc3O55013 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trappc3O55013 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trappc3O55013 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Trappc3O55013 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trappc3O55013 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trappc3O55013 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trappc3O55013 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Trappc3O55013 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trappc3O55013 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trappc3O55013 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trappc3O55013 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trappc3O55013 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trappc3O55013 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trappc3O55013 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trappc3O55013 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Trappc3O55013 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trappc3O55013 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trappc3O55013 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trappc3O55013 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trappc3O55013 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trappc3O55013 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trappc3O55013 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trappc3O55013 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trappc3O55013 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trappc3O55013 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trappc3O55013 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trappc3O55013 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trappc3O55013 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trappc3O55013 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trappc3O55013 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trappc3O55013 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trappc3O55013 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trappc3O55013 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trappc3O55013 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms