Protein–RNA interactions for Protein: O54949

Nlk, Serine/threonine-protein kinase NLK, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NlkO54949 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
NlkO54949 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NlkO54949 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NlkO54949 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NlkO54949 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NlkO54949 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NlkO54949 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NlkO54949 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NlkO54949 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NlkO54949 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
NlkO54949 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NlkO54949 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NlkO54949 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NlkO54949 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NlkO54949 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NlkO54949 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NlkO54949 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NlkO54949 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NlkO54949 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
NlkO54949 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
NlkO54949 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NlkO54949 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NlkO54949 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NlkO54949 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NlkO54949 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NlkO54949 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NlkO54949 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NlkO54949 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NlkO54949 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
NlkO54949 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NlkO54949 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NlkO54949 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NlkO54949 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NlkO54949 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NlkO54949 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NlkO54949 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NlkO54949 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NlkO54949 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NlkO54949 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NlkO54949 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NlkO54949 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NlkO54949 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NlkO54949 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NlkO54949 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NlkO54949 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NlkO54949 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NlkO54949 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NlkO54949 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
NlkO54949 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NlkO54949 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NlkO54949 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NlkO54949 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NlkO54949 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NlkO54949 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NlkO54949 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NlkO54949 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NlkO54949 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NlkO54949 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NlkO54949 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NlkO54949 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NlkO54949 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NlkO54949 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NlkO54949 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NlkO54949 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NlkO54949 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NlkO54949 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NlkO54949 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
NlkO54949 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NlkO54949 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
NlkO54949 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NlkO54949 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NlkO54949 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NlkO54949 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NlkO54949 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NlkO54949 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
NlkO54949 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NlkO54949 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NlkO54949 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NlkO54949 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NlkO54949 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
NlkO54949 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NlkO54949 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NlkO54949 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NlkO54949 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NlkO54949 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NlkO54949 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NlkO54949 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NlkO54949 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NlkO54949 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NlkO54949 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NlkO54949 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NlkO54949 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NlkO54949 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NlkO54949 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NlkO54949 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NlkO54949 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NlkO54949 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NlkO54949 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NlkO54949 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NlkO54949 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms