Protein–RNA interactions for Protein: O54946

Dnajb6, DnaJ homolog subfamily B member 6, mousemouse

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Length 365 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajb6O54946 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Dnajb6O54946 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Dnajb6O54946 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Dnajb6O54946 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Dnajb6O54946 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Dnajb6O54946 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Dnajb6O54946 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Dnajb6O54946 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Dnajb6O54946 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Dnajb6O54946 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Dnajb6O54946 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Dnajb6O54946 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Dnajb6O54946 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Dnajb6O54946 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Dnajb6O54946 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Dnajb6O54946 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Dnajb6O54946 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Dnajb6O54946 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Dnajb6O54946 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Dnajb6O54946 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Dnajb6O54946 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Dnajb6O54946 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Dnajb6O54946 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Dnajb6O54946 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Dnajb6O54946 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Dnajb6O54946 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Dnajb6O54946 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Dnajb6O54946 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Dnajb6O54946 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Dnajb6O54946 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Dnajb6O54946 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Dnajb6O54946 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Dnajb6O54946 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Dnajb6O54946 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Dnajb6O54946 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Dnajb6O54946 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Dnajb6O54946 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Dnajb6O54946 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Dnajb6O54946 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Dnajb6O54946 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Dnajb6O54946 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Dnajb6O54946 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Dnajb6O54946 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Dnajb6O54946 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Dnajb6O54946 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Dnajb6O54946 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Dnajb6O54946 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Dnajb6O54946 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Dnajb6O54946 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Dnajb6O54946 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Dnajb6O54946 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Dnajb6O54946 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Dnajb6O54946 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Dnajb6O54946 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Dnajb6O54946 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Dnajb6O54946 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Dnajb6O54946 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Dnajb6O54946 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Dnajb6O54946 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Dnajb6O54946 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Dnajb6O54946 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Dnajb6O54946 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Dnajb6O54946 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Dnajb6O54946 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Dnajb6O54946 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Dnajb6O54946 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Dnajb6O54946 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Dnajb6O54946 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Dnajb6O54946 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Dnajb6O54946 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Dnajb6O54946 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Dnajb6O54946 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Dnajb6O54946 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Dnajb6O54946 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Dnajb6O54946 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Dnajb6O54946 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Dnajb6O54946 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Dnajb6O54946 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Dnajb6O54946 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Dnajb6O54946 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Dnajb6O54946 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Dnajb6O54946 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Dnajb6O54946 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Dnajb6O54946 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Dnajb6O54946 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Dnajb6O54946 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Dnajb6O54946 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Dnajb6O54946 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Dnajb6O54946 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Dnajb6O54946 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Dnajb6O54946 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Dnajb6O54946 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Dnajb6O54946 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Dnajb6O54946 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Dnajb6O54946 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Dnajb6O54946 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Dnajb6O54946 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Dnajb6O54946 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Dnajb6O54946 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Dnajb6O54946 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms