Protein–RNA interactions for Protein: O54909

Rdh16, Cis-retinol androgen dehydrogenase 1, mousemouse

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Length 317 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh16O54909 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Rdh16O54909 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rdh16O54909 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rdh16O54909 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Rdh16O54909 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Rdh16O54909 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rdh16O54909 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Rdh16O54909 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Rdh16O54909 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Rdh16O54909 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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Rdh16O54909 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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Rdh16O54909 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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Rdh16O54909 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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Rdh16O54909 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rdh16O54909 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rdh16O54909 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rdh16O54909 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rdh16O54909 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rdh16O54909 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rdh16O54909 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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Rdh16O54909 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rdh16O54909 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rdh16O54909 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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Rdh16O54909 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Rdh16O54909 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rdh16O54909 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
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Rdh16O54909 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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