Protein–RNA interactions for Protein: O54732

Mmp15, Matrix metalloproteinase-15, mousemouse

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp15O54732 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Mmp15O54732 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Mmp15O54732 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Mmp15O54732 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Mmp15O54732 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Mmp15O54732 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Mmp15O54732 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Mmp15O54732 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Mmp15O54732 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Mmp15O54732 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Mmp15O54732 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Mmp15O54732 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Mmp15O54732 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Mmp15O54732 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Mmp15O54732 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Mmp15O54732 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Mmp15O54732 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Mmp15O54732 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Mmp15O54732 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Mmp15O54732 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Mmp15O54732 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Mmp15O54732 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Mmp15O54732 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Mmp15O54732 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Mmp15O54732 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Mmp15O54732 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Mmp15O54732 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Mmp15O54732 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Mmp15O54732 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Mmp15O54732 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Mmp15O54732 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Mmp15O54732 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Mmp15O54732 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Mmp15O54732 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Mmp15O54732 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Mmp15O54732 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Mmp15O54732 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Mmp15O54732 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Mmp15O54732 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Mmp15O54732 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Mmp15O54732 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Mmp15O54732 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Mmp15O54732 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Mmp15O54732 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Mmp15O54732 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Mmp15O54732 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Mmp15O54732 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Mmp15O54732 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Mmp15O54732 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Mmp15O54732 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Mmp15O54732 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Mmp15O54732 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Mmp15O54732 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Mmp15O54732 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Mmp15O54732 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Mmp15O54732 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Mmp15O54732 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Mmp15O54732 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Mmp15O54732 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Mmp15O54732 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Mmp15O54732 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Mmp15O54732 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Mmp15O54732 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Mmp15O54732 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Mmp15O54732 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Mmp15O54732 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Mmp15O54732 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Mmp15O54732 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Mmp15O54732 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Mmp15O54732 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Mmp15O54732 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Mmp15O54732 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Mmp15O54732 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Mmp15O54732 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Mmp15O54732 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Mmp15O54732 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mmp15O54732 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mmp15O54732 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mmp15O54732 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mmp15O54732 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mmp15O54732 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mmp15O54732 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mmp15O54732 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mmp15O54732 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mmp15O54732 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mmp15O54732 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mmp15O54732 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mmp15O54732 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mmp15O54732 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mmp15O54732 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mmp15O54732 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mmp15O54732 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mmp15O54732 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mmp15O54732 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mmp15O54732 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mmp15O54732 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mmp15O54732 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mmp15O54732 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mmp15O54732 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mmp15O54732 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms