Protein–RNA interactions for Protein: O35711

Ppfibp2, Liprin-beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfibp2O35711 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ppfibp2O35711 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ppfibp2O35711 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ppfibp2O35711 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ppfibp2O35711 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ppfibp2O35711 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Ppfibp2O35711 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ppfibp2O35711 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ppfibp2O35711 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ppfibp2O35711 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ppfibp2O35711 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ppfibp2O35711 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ppfibp2O35711 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ppfibp2O35711 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ppfibp2O35711 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ppfibp2O35711 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ppfibp2O35711 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ppfibp2O35711 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ppfibp2O35711 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ppfibp2O35711 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Ppfibp2O35711 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ppfibp2O35711 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ppfibp2O35711 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ppfibp2O35711 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ppfibp2O35711 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ppfibp2O35711 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Ppfibp2O35711 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ppfibp2O35711 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ppfibp2O35711 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ppfibp2O35711 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ppfibp2O35711 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ppfibp2O35711 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ppfibp2O35711 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ppfibp2O35711 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ppfibp2O35711 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ppfibp2O35711 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ppfibp2O35711 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ppfibp2O35711 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ppfibp2O35711 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ppfibp2O35711 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Ppfibp2O35711 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Ppfibp2O35711 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Ppfibp2O35711 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ppfibp2O35711 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ppfibp2O35711 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ppfibp2O35711 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ppfibp2O35711 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ppfibp2O35711 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ppfibp2O35711 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ppfibp2O35711 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Ppfibp2O35711 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ppfibp2O35711 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Ppfibp2O35711 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Ppfibp2O35711 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ppfibp2O35711 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ppfibp2O35711 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Ppfibp2O35711 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ppfibp2O35711 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ppfibp2O35711 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ppfibp2O35711 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ppfibp2O35711 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ppfibp2O35711 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ppfibp2O35711 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ppfibp2O35711 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ppfibp2O35711 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ppfibp2O35711 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ppfibp2O35711 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ppfibp2O35711 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ppfibp2O35711 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ppfibp2O35711 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ppfibp2O35711 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ppfibp2O35711 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ppfibp2O35711 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ppfibp2O35711 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Ppfibp2O35711 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ppfibp2O35711 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ppfibp2O35711 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ppfibp2O35711 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Ppfibp2O35711 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ppfibp2O35711 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ppfibp2O35711 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ppfibp2O35711 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ppfibp2O35711 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ppfibp2O35711 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ppfibp2O35711 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ppfibp2O35711 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ppfibp2O35711 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ppfibp2O35711 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ppfibp2O35711 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ppfibp2O35711 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Ppfibp2O35711 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ppfibp2O35711 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ppfibp2O35711 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Ppfibp2O35711 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ppfibp2O35711 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Ppfibp2O35711 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ppfibp2O35711 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ppfibp2O35711 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ppfibp2O35711 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ppfibp2O35711 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms