Protein–RNA interactions for Protein: O35424

H2-Ob, Histocompatibility 2, O region beta locus, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-ObO35424 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
H2-ObO35424 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
H2-ObO35424 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
H2-ObO35424 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
H2-ObO35424 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
H2-ObO35424 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
H2-ObO35424 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
H2-ObO35424 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
H2-ObO35424 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
H2-ObO35424 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
H2-ObO35424 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
H2-ObO35424 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
H2-ObO35424 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
H2-ObO35424 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
H2-ObO35424 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
H2-ObO35424 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
H2-ObO35424 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
H2-ObO35424 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
H2-ObO35424 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
H2-ObO35424 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
H2-ObO35424 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
H2-ObO35424 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
H2-ObO35424 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
H2-ObO35424 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
H2-ObO35424 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
H2-ObO35424 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
H2-ObO35424 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
H2-ObO35424 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
H2-ObO35424 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
H2-ObO35424 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
H2-ObO35424 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
H2-ObO35424 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
H2-ObO35424 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
H2-ObO35424 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
H2-ObO35424 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
H2-ObO35424 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
H2-ObO35424 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
H2-ObO35424 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
H2-ObO35424 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
H2-ObO35424 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
H2-ObO35424 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
H2-ObO35424 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
H2-ObO35424 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
H2-ObO35424 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
H2-ObO35424 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
H2-ObO35424 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
H2-ObO35424 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
H2-ObO35424 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
H2-ObO35424 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
H2-ObO35424 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
H2-ObO35424 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
H2-ObO35424 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
H2-ObO35424 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
H2-ObO35424 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
H2-ObO35424 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
H2-ObO35424 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
H2-ObO35424 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
H2-ObO35424 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
H2-ObO35424 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
H2-ObO35424 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
H2-ObO35424 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
H2-ObO35424 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
H2-ObO35424 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
H2-ObO35424 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
H2-ObO35424 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
H2-ObO35424 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
H2-ObO35424 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
H2-ObO35424 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
H2-ObO35424 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
H2-ObO35424 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
H2-ObO35424 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
H2-ObO35424 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
H2-ObO35424 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
H2-ObO35424 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
H2-ObO35424 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
H2-ObO35424 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
H2-ObO35424 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
H2-ObO35424 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
H2-ObO35424 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
H2-ObO35424 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
H2-ObO35424 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
H2-ObO35424 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
H2-ObO35424 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
H2-ObO35424 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
H2-ObO35424 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
H2-ObO35424 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
H2-ObO35424 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
H2-ObO35424 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
H2-ObO35424 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
H2-ObO35424 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
H2-ObO35424 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
H2-ObO35424 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
H2-ObO35424 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
H2-ObO35424 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
H2-ObO35424 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
H2-ObO35424 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
H2-ObO35424 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
H2-ObO35424 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
H2-ObO35424 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
H2-ObO35424 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms