Protein–RNA interactions for Protein: O35304

Slc18a3, Vesicular acetylcholine transporter, mousemouse

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc18a3O35304 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
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Slc18a3O35304 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc18a3O35304 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
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Slc18a3O35304 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc18a3O35304 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc18a3O35304 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
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Slc18a3O35304 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc18a3O35304 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
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Slc18a3O35304 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc18a3O35304 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc18a3O35304 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
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Slc18a3O35304 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc18a3O35304 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
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Slc18a3O35304 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc18a3O35304 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc18a3O35304 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc18a3O35304 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc18a3O35304 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
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Slc18a3O35304 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
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Slc18a3O35304 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc18a3O35304 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc18a3O35304 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
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Slc18a3O35304 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
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Slc18a3O35304 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc18a3O35304 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
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Slc18a3O35304 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
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Slc18a3O35304 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc18a3O35304 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
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Slc18a3O35304 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc18a3O35304 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc18a3O35304 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc18a3O35304 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc18a3O35304 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc18a3O35304 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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Slc18a3O35304 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc18a3O35304 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc18a3O35304 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc18a3O35304 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc18a3O35304 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc18a3O35304 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc18a3O35304 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc18a3O35304 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc18a3O35304 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc18a3O35304 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc18a3O35304 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc18a3O35304 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc18a3O35304 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc18a3O35304 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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Slc18a3O35304 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc18a3O35304 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc18a3O35304 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc18a3O35304 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms