Protein–RNA interactions for Protein: O35185

Bhlhe40, Class E basic helix-loop-helix protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe40O35185 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Bhlhe40O35185 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Bhlhe40O35185 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Bhlhe40O35185 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Bhlhe40O35185 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Bhlhe40O35185 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Bhlhe40O35185 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Bhlhe40O35185 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Bhlhe40O35185 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Bhlhe40O35185 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Bhlhe40O35185 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Bhlhe40O35185 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Bhlhe40O35185 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Bhlhe40O35185 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Bhlhe40O35185 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Bhlhe40O35185 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Bhlhe40O35185 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Bhlhe40O35185 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Bhlhe40O35185 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Bhlhe40O35185 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Bhlhe40O35185 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Bhlhe40O35185 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Bhlhe40O35185 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Bhlhe40O35185 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Bhlhe40O35185 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Bhlhe40O35185 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Bhlhe40O35185 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Bhlhe40O35185 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Bhlhe40O35185 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Bhlhe40O35185 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Bhlhe40O35185 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Bhlhe40O35185 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Bhlhe40O35185 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Bhlhe40O35185 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Bhlhe40O35185 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Bhlhe40O35185 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Bhlhe40O35185 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Bhlhe40O35185 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Bhlhe40O35185 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Bhlhe40O35185 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Bhlhe40O35185 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Bhlhe40O35185 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Bhlhe40O35185 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Bhlhe40O35185 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Bhlhe40O35185 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Bhlhe40O35185 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Bhlhe40O35185 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Bhlhe40O35185 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Bhlhe40O35185 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Bhlhe40O35185 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Bhlhe40O35185 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Bhlhe40O35185 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Bhlhe40O35185 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Bhlhe40O35185 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Bhlhe40O35185 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Bhlhe40O35185 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Bhlhe40O35185 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Bhlhe40O35185 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Bhlhe40O35185 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Bhlhe40O35185 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Bhlhe40O35185 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Bhlhe40O35185 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Bhlhe40O35185 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Bhlhe40O35185 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Bhlhe40O35185 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Bhlhe40O35185 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Bhlhe40O35185 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Bhlhe40O35185 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Bhlhe40O35185 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Bhlhe40O35185 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Bhlhe40O35185 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Bhlhe40O35185 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Bhlhe40O35185 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Bhlhe40O35185 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Bhlhe40O35185 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Bhlhe40O35185 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Bhlhe40O35185 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Bhlhe40O35185 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Bhlhe40O35185 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Bhlhe40O35185 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Bhlhe40O35185 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Bhlhe40O35185 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Bhlhe40O35185 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Bhlhe40O35185 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Bhlhe40O35185 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Bhlhe40O35185 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Bhlhe40O35185 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Bhlhe40O35185 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Bhlhe40O35185 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Bhlhe40O35185 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Bhlhe40O35185 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Bhlhe40O35185 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Bhlhe40O35185 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Bhlhe40O35185 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Bhlhe40O35185 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Bhlhe40O35185 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Bhlhe40O35185 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Bhlhe40O35185 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Bhlhe40O35185 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Bhlhe40O35185 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms