Protein–RNA interactions for Protein: O35134

Polr1a, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1aO35134 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Polr1aO35134 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Polr1aO35134 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Polr1aO35134 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Polr1aO35134 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Polr1aO35134 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Polr1aO35134 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Polr1aO35134 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Polr1aO35134 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Polr1aO35134 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Polr1aO35134 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC29.45■■■□□ 2.3
Polr1aO35134 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
Polr1aO35134 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Polr1aO35134 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
Polr1aO35134 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
Polr1aO35134 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Polr1aO35134 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Polr1aO35134 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Polr1aO35134 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Polr1aO35134 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Polr1aO35134 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Polr1aO35134 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Polr1aO35134 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Polr1aO35134 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Polr1aO35134 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Polr1aO35134 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Polr1aO35134 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
Polr1aO35134 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Polr1aO35134 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
Polr1aO35134 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
Polr1aO35134 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
Polr1aO35134 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Polr1aO35134 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Polr1aO35134 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Polr1aO35134 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
Polr1aO35134 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Polr1aO35134 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Polr1aO35134 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Polr1aO35134 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Polr1aO35134 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Polr1aO35134 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Polr1aO35134 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Polr1aO35134 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Polr1aO35134 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Polr1aO35134 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Polr1aO35134 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Polr1aO35134 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Polr1aO35134 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Polr1aO35134 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Polr1aO35134 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Polr1aO35134 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Polr1aO35134 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Polr1aO35134 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Polr1aO35134 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Polr1aO35134 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Polr1aO35134 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Polr1aO35134 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Polr1aO35134 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Polr1aO35134 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Polr1aO35134 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Polr1aO35134 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
Polr1aO35134 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Polr1aO35134 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Polr1aO35134 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Polr1aO35134 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Polr1aO35134 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Polr1aO35134 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Polr1aO35134 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Polr1aO35134 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Polr1aO35134 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Polr1aO35134 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Polr1aO35134 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Polr1aO35134 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
Polr1aO35134 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Polr1aO35134 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Polr1aO35134 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Polr1aO35134 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Polr1aO35134 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Polr1aO35134 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Polr1aO35134 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Polr1aO35134 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Polr1aO35134 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Polr1aO35134 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Polr1aO35134 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Polr1aO35134 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Polr1aO35134 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Polr1aO35134 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Polr1aO35134 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Polr1aO35134 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Polr1aO35134 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Polr1aO35134 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Polr1aO35134 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Polr1aO35134 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Polr1aO35134 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Polr1aO35134 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Polr1aO35134 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Polr1aO35134 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Polr1aO35134 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Polr1aO35134 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Polr1aO35134 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms